Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  277  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
22
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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21
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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52
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6
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20.5
2
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5
64
50
0
2
47
1.14
86204786--86204833
15
3.6
14
81
18
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62
0
33
4
1.14
86204791--86204839
24
2.0
26
84
8
66
61
0
34
4
1.15
86205221--86205330
49
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51
78
15
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22
0
12
63
1.34
86205557--86205588
2
16.5
2
93
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57
46
0
0
53
1.00
86208623--86208647
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12
100
0
50
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0
8
32
1.26
86208638--86208714
16
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16
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2
27
1.32
86208630--86208751
14
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13
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26
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62
4
3
30
1.30
86208693--86208762
11
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11
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0
2
32
1.08
86208688--86208754
24
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0
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1.09
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205
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16
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16
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86222905--86223014
49
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51
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124
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0
12
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1.34
86223241--86223270
2
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2
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46
0
0
53
1.00
86226306--86226330
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2.1
12
100
0
50
60
0
8
32
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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2
27
1.32
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14
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13
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26
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4
3
30
1.30
86226376--86226445
11
6.3
11
72
19
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64
0
2
32
1.08
86226371--86226437
24
2.8
25
84
8
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64
0
2
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1.09
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2.5
18
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0
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1.76
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22
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14
0
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1.92
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1.42
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2.4
56
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4
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1.39
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18
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28
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48
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2.2
22
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21
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25
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1.88
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22
2.2
22
88
0
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1.32
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0
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0
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100
0
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0
42
50
1.31
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0
1
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20
2.0
22
86
9
61
45
0
0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86285536--86285581
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0
0
52
1.00
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4.6
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1
1
47
1.18
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0
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0
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0
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27
27
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86297901--86298277
193
1.9
193
84
5
501
28
27
8
35
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325