Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  24  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5555956--5556044
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5563247--5563300
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50
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1060
27
19
19
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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119
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1
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1
11
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12
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1.9
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23
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2.0
21
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21
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1.98
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1.9
16
93
0
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41
12
16
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1.85
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20
2.2
20
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2
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5
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1.63
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18
7.5
17
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4.0
35
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1.80
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4.2
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1
582
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20
20
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1.97
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5.0
119
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18
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5618387--5618976
235
2.5
238
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1
1017
30
18
17
33
1.95
5618968--5619146
44
4.1
44
76
9
186
27
25
15
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
2.4
21
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75
3
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0
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11
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4.0
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37
13
10
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2.0
254
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17
16
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4.2
25
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5
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52
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34
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1.78
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3.6
12
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1
175
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1.78
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6
50
19
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7
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1.59
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3.1
37
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9
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16
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0
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29
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15
13
50
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5676314--5676428
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1.9
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5
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50
5
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4.4
17
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20
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1
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1.9
23
85
0
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40
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4
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1.50
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20
100
0
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20
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26
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17
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2.8
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0
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17
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1
81
0.92
5713346--5713378
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
5716656--5716837
71
2.5
74
90
5
289
39
5
9
45
1.61
5724683--5724723
6
6.5
6
83
10
55
17
0
4
78
0.93
5724748--5724772
13
1.9
13
100
0
50
12
0
48
40
1.40
5724749--5724786
18
2.1
18
95
0
67
7
2
47
42
1.46
5726047--5726104
29
2.0
29
82
0
71
60
12
1
25
1.41
5726062--5726124
31
2.1
29
88
5
90
55
12
0
31
1.37
5726385--5726429
23
2.0
23
90
0
72
46
2
0
51
1.13
5732712--5733031
128
2.5
127
86
3
444
26
18
20
35
1.95
5733962--5734040
19
4.2
19
70
12
56
51
2
2
43
1.28
5733960--5734041
20
4.3
20
70
17
59
52
2
2
42
1.27
5734300--5734369
10
7.1
10
74
19
51
38
4
0
57
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5734314--5734354
21
1.9
22
85
14
59
34
4
0
60
1.18
5738696--5738781
30
2.9
30
94
3
147
10
29
37
23
1.88
5738717--5738769
17
3.4
17
70
20
60
9
22
41
26
1.84
5740621--5740729
6
18.3
6
91
1
139
77
0
5
16
1.01
5742407--5742459
20
2.8
20
83
16
76
66
3
3
26
1.26
5755103--5755658
206
2.7
206
86
1
790
29
21
17
31
1.96
5756543--5756583
21
1.9
21
85
5
55
2
4
7
85
0.81
5756543--5756604
25
2.5
23
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14
70
3
6
6
83
0.88
5756561--5756611
27
1.9
27
92
4
86
5
7
7
78
1.09
5761445--5761496
19
2.7
19
88
5
54
65
0
0
34
0.93
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26
2.4
26
86
0
81
61
0
1
36
1.05
5761438--5761494
7
8.7
7
74
14
50
61
0
0
38
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8
7.6
7
79
16
51
1
12
0
85
0.68
5766360--5766409
26
2.0
25
84
4
64
62
0
2
36
1.07
5766387--5766445
17
3.5
17
70
25
54
64
0
1
33
1.04
5766928--5767053
19
6.9
18
88
5
175
36
15
10
37
1.82
5766928--5767045
35
3.3
35
92
3
191
36
15
11
37
1.83
5766928--5767050
17
6.8
18
87
10
96
36
15
10
37
1.82
5785384--5785409
13
2.0
13
100
0
52
38
0
15
46
1.46
5786729--5786757
15
1.9
15
100
0
58
37
6
6
48
1.57
5790033--5790154
45
2.7
45
80
6
106
26
20
13
39
1.90
5803347--5803433
29
3.0
30
79
17
103
25
14
32
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5803347--5803433
28
3.0
29
79
14
99
25
14
32
27
1.95
5805172--5805211
15
2.6
15
92
4
62
25
0
5
70
1.08
5808753--5808898
30
4.9
30
76
5
109
27
32
22
17
1.97
5811329--5811440
27
4.2
26
83
7
134
37
22
23
16
1.94
5811329--5811440
54
2.1
54
86
3
154
37
22
23
16
1.94
5812851--5812921
24
3.0
24
95
0
124
25
38
1
35
1.65
5817035--5817072
6
6.0
6
90
9
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0
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0.86
5817035--5817072
13
3.0
12
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3
58
78
0
2
18
0.86
5817035--5817081
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19
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7
76
76
0
4
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0.95
5817594--5817627
8
4.4
8
92
7
61
0
0
11
88
0.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325