Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  203  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63053646--63053897
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26
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1.98
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20
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25
2.0
25
85
7
68
23
31
13
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
20
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1.99
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1.81
63109780--63110264
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5.1
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30
26
6
36
1.81
63109780--63110264
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3.4
144
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1
866
30
26
6
36
1.81
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50
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50
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17
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1.8
101
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29
26
18
25
1.98
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1
200
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13
19
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20
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63
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2
2
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1.04
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2
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1.18
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48
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3
147
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1.94
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1.83
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1.82
63150154--63150358
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2.5
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243
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20
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1.81
63150154--63150386
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211
42
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7
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1.80
63150365--63150450
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3.1
27
75
20
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40
12
8
38
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
1.98
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1.9
16
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29
19
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1.93
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3.3
25
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23
22
1.99
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4.5
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90
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1.98
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220
27
18
25
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1.98
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1.9
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1.98
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2.1
22
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4
67
55
6
0
38
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63213626--63213699
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2.5
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3.3
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2.0
17
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0
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20
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15
11
1.57
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30
2.7
30
81
11
92
58
13
15
12
1.63
63229577--63229654
15
5.2
15
72
20
56
58
14
14
12
1.63
63232571--63232745
46
3.8
46
80
11
205
29
29
20
20
1.97
63232579--63232749
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1.8
93
92
1
290
28
29
20
21
1.98
63239246--63239470
40
5.6
40
85
2
290
23
27
24
25
2.00
63239210--63239470
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3.3
80
83
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303
23
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24
25
2.00
63241361--63241430
27
2.6
27
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2
122
30
27
14
28
1.95
63244314--63244365
21
2.5
21
93
0
95
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1.90
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1.95
63248892--63248976
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0
63
1.30
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20
0
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12
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5
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9
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70
1.26
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12
2.5
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0
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1.85
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21
3.2
20
79
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2
16
2
77
1.01
63250030--63250070
11
3.6
11
87
12
57
14
7
7
70
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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12
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13
6
6
72
1.27
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30
3.2
30
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1.95
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4
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4
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0
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0
0
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2.2
29
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2
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25
15
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1.93
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25
2.2
26
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3
103
34
5
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1.71
63257311--63257374
25
2.6
25
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5
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1.76
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2.0
480
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0
1606
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1.98
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2.0
13
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0
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28
1.98
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0
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0
0
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2.00
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2.00
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26
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1.99
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258
26
26
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1.99
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22
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22
1.99
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2.7
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128
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25
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1.99
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1
124
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24
26
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1.99
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23
24
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24
2.00
63315797--63315894
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2.3
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8
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2.1
15
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2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63320286--63320323
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1.9
20
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50
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2
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15.5
991
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28012
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1.9
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1.9
80
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2
183
22
30
24
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1.99
63345055--63345162
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2.7
38
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128
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93
0
57
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0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325