Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  302  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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19
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10
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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21
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28
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39
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27
20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
204
24
14
24
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92573487--92573892
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2.1
30
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18
18
34
1.95
92574543--92574779
72
3.2
72
83
8
287
31
16
17
34
1.92
92574733--92574828
49
2.0
49
95
0
174
30
15
20
33
1.94
92574661--92574900
121
2.0
121
93
0
408
31
15
19
33
1.93
92574782--92575135
75
4.7
75
86
6
450
31
16
19
32
1.94
92574782--92575345
154
3.6
149
77
14
467
31
17
18
32
1.94
92575058--92575228
93
1.8
93
82
5
220
27
19
19
33
1.96
92575129--92575514
79
4.7
77
76
11
317
28
17
17
36
1.93
92575364--92575401
13
2.8
14
84
4
51
31
13
2
52
1.54
92575308--92575773
88
5.4
86
71
9
306
27
16
19
36
1.93
92575499--92575557
29
2.0
30
93
3
102
20
6
28
44
1.77
92574980--92575725
243
3.0
249
83
6
867
28
17
19
35
1.94
92576378--92576466
32
2.8
33
86
10
132
75
13
6
4
1.16
92576505--92576535
13
2.5
13
94
5
55
9
41
0
48
1.36
92579143--92579285
3
47.0
3
76
13
114
62
2
6
29
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92580671--92580772
32
3.3
30
72
11
82
55
9
3
30
1.50
92580985--92581027
18
2.4
19
81
14
56
65
0
0
34
0.93
92580981--92581011
15
2.1
15
100
0
62
58
0
0
41
0.98
92604158--92604196
19
2.1
19
85
9
53
56
2
10
30
1.46
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21
2.2
21
88
7
67
60
0
4
34
1.16
92604219--92604265
12
3.9
11
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17
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63
0
2
34
1.06
92606132--92606170
21
1.9
20
89
5
60
64
7
0
28
1.21
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17
4.4
17
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28
52
60
9
1
28
1.36
92607218--92607299
25
3.2
24
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62
20
3
14
60
1.49
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15
2.3
15
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0
61
20
11
25
42
1.85
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31
2.3
31
82
0
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32
18
21
28
1.96
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3.1
89
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5
344
37
18
19
25
1.94
92614931--92614956
13
2.0
13
100
0
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30
7
15
46
1.74
92616047--92616228
49
3.7
49
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2
274
25
20
26
27
1.99
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100
1.9
100
98
0
367
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21
26
27
1.99
92617425--92617510
18
4.7
18
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1
100
40
13
9
36
1.77
92617425--92617513
36
2.4
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84
1
126
39
14
10
35
1.80
92617638--92617744
47
2.3
47
90
0
160
42
22
18
15
1.88
92617632--92617756
47
2.5
50
78
12
139
43
21
19
16
1.88
92617935--92617991
21
2.8
20
73
21
55
36
7
0
56
1.27
92626598--92626703
55
1.9
55
82
3
133
27
12
19
40
1.87
92634672--92634697
13
2.0
13
100
0
52
23
23
15
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92645505--92645650
33
4.5
33
78
5
118
28
24
14
32
1.94
92645637--92645694
30
1.9
30
86
6
82
37
17
12
32
1.86
92646394--92646436
20
2.0
21
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32
20
0
46
1.51
92646406--92646448
20
2.2
20
87
8
61
37
20
0
41
1.53
92655057--92655118
30
2.0
31
93
3
108
38
30
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24
1.80
92656752--92656803
21
2.5
21
100
0
104
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92656877--92656992
58
2.0
59
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1
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11
13
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4
2
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1.36
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1.9
15
100
0
58
24
6
6
62
1.45
92672682--92672729
13
3.7
13
78
10
62
31
0
12
56
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325