Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  120  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36026932--36027201
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48
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4
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1.98
36033561--36033723
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4.2
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3
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1.99
36033616--36033796
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2.3
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2.00
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0
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1.98
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183
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23
30
26
1.98
36042936--36043134
78
2.5
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206
22
22
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1.99
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2.0
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0
100
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1.98
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10
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29
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20
1.98
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5.2
50
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245
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1.98
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1.8
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2
233
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168
29
19
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24
1.98
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38
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20
20
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1.97
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1.9
231
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1
710
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20
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32
1.97
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2.0
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56
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6
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2
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31
1.42
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1
5
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1.30
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16
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63
0
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1.12
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81
12
123
62
0
3
34
1.12
36068123--36068185
16
4.1
16
72
12
51
63
0
3
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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0
3
34
1.13
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2.9
24
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0
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28
1.25
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0
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2.0
22
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30
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5
233
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25
23
24
2.00
36070311--36070526
80
2.7
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267
26
25
23
24
2.00
36078418--36078628
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5.3
40
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257
26
27
22
24
2.00
36081075--36081627
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2.7
207
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30
1.97
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20
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1
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1
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0
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1
8
4
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36082501--36082611
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104
0
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3
82
0.84
36082502--36082611
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6.9
16
76
10
84
0
12
3
82
0.84
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111
0
17
0
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2.0
22
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28
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3.9
39
92
0
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20
31
23
1.98
36087454--36087636
39
4.6
39
88
0
240
24
22
30
22
1.99
36087460--36087674
78
2.7
79
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5
177
25
22
30
22
1.99
36095398--36095550
39
3.9
39
91
0
234
24
20
30
23
1.99
36095399--36095581
39
4.6
39
88
0
231
24
22
30
22
1.99
36104702--36104745
22
2.0
22
83
12
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56
6
6
29
1.51
36104860--36104934
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23
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2
6
32
1.38
36104951--36105149
8
25.1
8
69
15
87
58
1
5
35
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36104870--36105147
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5
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1.31
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145
58
0
5
34
1.27
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5
16.4
5
71
18
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1
1
35
1.11
36105070--36105163
26
3.8
26
74
17
76
62
2
1
34
1.14
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2.2
27
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11
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60
1
1
36
1.17
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3.8
54
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4
232
22
25
17
35
1.95
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44
2.6
44
88
0
163
24
20
13
41
1.88
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5.5
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82
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180
26
16
31
25
1.97
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29
4.5
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122
25
17
32
25
1.97
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30
13
27
1.94
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3.1
29
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28
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1.96
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43
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18
27
1.98
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25
1.99
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1.99
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1.99
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138
25
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1.98
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28
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28
1.99
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159
22
25
22
29
1.99
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2.6
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30
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14
27
1.95
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2.0
13
100
0
52
53
7
0
38
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36171794--36172021
96
2.4
96
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3
237
25
25
19
29
1.99
36171793--36172021
48
4.8
48
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205
25
24
20
29
1.99
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3.3
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21
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2.0
20
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28
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27
29
1.95
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29
2.5
28
91
6
110
29
13
27
29
1.95
36215851--36215982
29
4.6
29
82
0
147
26
15
33
24
1.95
36217502--36217602
28
3.5
28
86
6
114
28
13
27
29
1.95
36217531--36217602
29
2.5
28
91
6
110
29
13
27
29
1.95
36219017--36219046
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
36221350--36221377
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13
100
0
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28
0
14
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1.38
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40
4.8
40
92
1
301
22
21
26
30
1.98
36224873--36225043
43
4.0
43
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11
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27
17
23
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1.97
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39
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39
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0
263
23
20
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24
1.98
36227954--36228146
39
4.9
39
90
0
251
23
21
31
23
1.98
36234500--36234569
27
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31
25
14
28
1.95
36242575--36242644
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
36247794--36247911
29
4.1
28
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6
105
27
29
15
27
1.96
36248190--36248234
22
2.0
22
91
0
72
28
22
24
24
1.99
36258937--36258998
21
2.9
21
85
2
88
20
27
38
12
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
96
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5
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24
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18
26
1.97
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46
2.7
46
86
4
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23
28
18
29
1.97
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11
2.3
11
100
0
50
28
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16
20
1.93
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22
3.6
22
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0
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24
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2.3
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1
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19
28
18
34
1.95
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70
2.8
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20
28
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1.96
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70
2.3
71
97
1
310
19
28
18
34
1.95
36275709--36275905
70
2.8
70
90
4
249
20
28
17
32
1.96
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1.89
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28
1.98
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2.0
60
100
0
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2.0
18
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0
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0
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17
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28
24
24
2.00
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3.0
29
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29
29
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1.93
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2.3
16
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0
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13
16
13
56
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2.1
18
100
0
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0
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0
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11
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50
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0
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0
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0
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0
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19
2.5
19
89
10
69
67
0
32
0
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36328247--36328301
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19
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0
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0
0.87
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0
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0
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1.9
17
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0
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0
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0
0.68
36328337--36328366
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5
53
16
0
83
0
0.65
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29
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2
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28
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1.94
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0
304
26
32
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1.95
36349506--36349698
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2.2
87
89
3
300
26
31
16
25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325