Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  281  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87154147--87154345
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2.2
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5
64
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.2
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0
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0
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17
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2
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1.62
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99
79
8
243
40
16
18
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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17
28
1.97
87206267--87206560
74
4.0
74
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32
22
17
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1.96
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4.5
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31
23
16
28
1.96
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1.92
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1.9
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0
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0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87262294--87262342
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2.0
24
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32
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1.55
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120
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0
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28
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34
1
7
56
1.38
87274204--87274237
14
2.4
14
100
0
68
29
55
8
5
1.54
87274810--87274852
23
1.9
23
85
4
61
0
44
0
55
0.99
87275284--87275347
3
21.0
3
87
3
92
31
1
4
62
1.25
87275531--87275589
29
2.1
29
82
14
72
25
10
1
62
1.36
87275553--87275603
21
2.3
22
83
12
61
25
11
1
60
1.41
87288152--87288550
70
5.5
71
76
10
306
30
16
22
30
1.96
87288151--87288481
150
2.3
145
89
5
497
30
17
22
30
1.96
87288589--87288917
68
4.7
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69
13
243
24
14
19
41
1.89
87288453--87288910
211
2.1
215
96
2
843
24
15
19
40
1.90
87289624--87289651
14
2.0
14
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0
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57
7
7
1.52
87290225--87290267
23
1.9
23
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4
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0
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55
0.99
87290698--87290761
3
21.0
3
87
3
92
31
1
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62
1.25
87290945--87291003
29
2.1
29
82
14
72
25
10
1
62
1.36
87290967--87291017
21
2.3
22
83
12
61
25
11
1
60
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87293835--87294076
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6.1
40
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2
310
27
26
21
24
1.99
87301124--87301367
40
6.1
40
87
2
303
27
26
21
24
1.99
87307657--87307921
136
1.9
137
86
3
374
32
18
16
32
1.93
87307688--87308180
131
3.7
131
77
5
377
28
19
17
34
1.95
87325511--87325568
21
2.7
20
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22
3
3
70
1.17
87331475--87331650
46
3.8
46
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12
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22
22
27
27
1.99
87331472--87331642
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1.8
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0
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22
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1.99
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5
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5
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0
0
17
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87343664--87343697
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2.1
16
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0
68
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0
0
17
0.67
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25
21
1.95
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1.8
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1.96
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1.9
16
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0
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41
0
22
35
1.54
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52
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6
212
34
17
24
22
1.96
87353977--87354174
108
1.8
110
88
2
310
34
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24
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1.96
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1.9
16
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0
53
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0
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23
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84
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1.95
87360261--87360328
22
3.0
22
83
16
86
33
20
27
17
1.95
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2.0
42
100
0
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23
19
17
40
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41
2.1
41
100
0
172
22
20
26
30
1.98
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12
2.1
12
100
0
50
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0
0
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0
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20
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1.89
87370844--87370938
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87370845--87370938
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
87371130--87371292
38
4.4
38
84
11
232
38
15
22
23
1.93
87371154--87371269
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3.5
31
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15
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13
20
24
1.89
87371130--87371269
69
2.0
69
97
0
262
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15
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87377669--87377716
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1.9
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20
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0
100
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20
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133
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21
24
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1.99
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4.1
31
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16
151
39
15
21
22
1.92
87378201--87378308
38
2.8
38
94
1
189
39
14
22
23
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325