Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  12  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2686433--2686546
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2.2
52
81
4
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13
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2689421--2689481
26
2.2
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0
1
49
1.10
2692301--2692411
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2692318--2692415
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5.2
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155
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1.80
2692340--2692396
17
3.5
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11
53
35
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1.82
2692318--2692408
36
2.4
37
92
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148
36
15
9
38
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2692755--2692857
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0
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16
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2.1
28
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0
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2.1
28
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0
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15
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10
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26
28
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26
4.2
26
97
0
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36
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6
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1.82
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19
1.9
19
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0
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48
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5
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1.49
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19
1.9
19
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0
56
40
5
5
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1.49
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16
3.2
16
88
0
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29
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10
80
42
1
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0
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0
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0
0
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3.5
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5
2
34
1.36
2725310--2725351
17
2.5
17
84
3
59
54
0
9
35
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2725433--2725503
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19
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63
0
2
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1.09
2725425--2725507
12
7.1
12
70
22
61
63
0
2
33
1.07
2725526--2725558
17
1.9
17
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11
50
48
0
9
42
1.35
2727262--2727309
20
2.3
20
82
3
69
25
14
12
47
1.79
2728103--2728154
25
2.1
25
96
0
95
30
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1.93
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46
2.1
48
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109
32
26
14
26
1.95
2736464--2736530
22
3.1
21
77
14
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38
19
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16
1.92
2736506--2736668
25
6.5
25
91
2
256
32
19
25
22
1.97
2743828--2743929
53
1.9
52
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2
141
25
18
24
31
1.98
2747324--2747713
128
3.1
127
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385
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25
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24
1.72
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124
2.4
126
80
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339
46
24
4
24
1.72
2747379--2747714
125
2.7
126
79
6
387
44
25
4
25
1.71
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21
2.0
22
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40
2
0
57
1.12
2756804--2756924
9
13.4
9
70
14
81
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1
4
33
1.26
2756814--2756906
34
2.6
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1
3
34
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10
3.7
9
88
11
50
57
0
0
42
0.98
2756883--2756928
19
2.4
20
85
7
60
56
2
2
39
1.24
2757042--2757082
21
2.0
21
95
4
75
60
0
4
34
1.18
2757048--2757082
11
3.3
11
84
8
54
65
0
2
31
1.07
2759292--2759316
11
2.3
11
100
0
50
76
8
0
16
1.02
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17
4.2
17
74
19
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61
2
1
34
1.19
2762450--2762583
9
14.8
9
68
18
57
62
4
1
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
33
90
3
101
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0
1
31
1.01
2763198--2763248
19
2.7
20
78
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61
37
1
1
58
1.20
2763194--2763351
9
17.1
9
67
17
67
32
3
3
60
1.30
2764254--2764305
15
3.3
15
89
5
68
38
25
11
25
1.89
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51
2.6
51
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6
139
35
15
8
40
1.77
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31
2.1
32
97
2
125
22
16
3
57
1.53
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31
2.7
31
84
15
111
19
15
2
62
1.43
2782183--2782284
24
4.4
25
72
18
69
32
5
3
57
1.41
2782573--2782623
25
2.1
24
81
3
57
23
5
3
66
1.30
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18.1
45
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241
26
18
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1.98
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6.4
132
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19
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1.99
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2.3
25
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5
5
56
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2
100
0
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0
0
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1.00
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26
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1
227
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4
24
36
1.76
2795613--2795746
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227
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24
36
1.76
2796918--2796953
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0
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22
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1.70
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0
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1.71
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1.75
2807401--2807534
51
2.6
51
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234
34
4
23
37
1.75
2810425--2810550
59
2.2
56
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155
34
10
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34
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15
2.1
14
93
6
51
43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2812033--2812101
12
5.7
12
72
8
50
20
10
1
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1.27
2813651--2813786
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11
132
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16
7
39
1.77
2814696--2815032
124
2.7
124
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3
399
24
4
24
46
1.70
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2.2
53
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135
37
14
8
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1.77
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51
1.9
51
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128
37
14
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1.73
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5
15
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1.58
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2.8
42
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13
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2.0
108
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19
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0
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0
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21
2.0
22
85
4
59
38
21
4
35
1.75
2835203--2835232
15
2.0
15
100
0
60
13
33
26
26
1.93
2842189--2842261
37
1.9
39
83
5
96
57
0
1
41
1.07
2848597--2848663
34
2.0
34
93
0
116
50
13
11
23
1.75
2860663--2860691
14
2.1
14
93
6
51
65
0
0
34
0.93
2862125--2862159
18
1.9
18
88
0
52
42
5
0
51
1.25
2865427--2865541
44
2.6
45
85
2
151
35
13
22
27
1.92
2870899--2871044
53
2.7
53
86
6
179
30
27
14
27
1.95
2875284--2875387
44
2.3
44
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8
131
28
25
13
32
1.93
2875300--2875387
45
2.0
44
91
6
142
27
26
13
32
1.94
2878777--2878862
45
2.0
43
90
4
136
32
13
24
29
1.94
2884971--2885009
20
2.0
20
100
0
78
33
15
5
46
1.68
2885076--2885116
15
2.6
16
78
21
50
36
4
2
56
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2888566--2888637
29
2.4
29
86
4
90
37
9
8
44
1.68
2888569--2888708
31
4.6
31
73
11
103
36
11
7
45
1.68
2888569--2888720
62
2.5
59
77
9
153
36
13
7
43
1.71
2890835--2890890
25
2.3
25
93
3
96
57
26
8
7
1.55
2906297--2906331
15
2.3
15
90
0
52
22
5
0
71
1.07
2906312--2906390
3
26.7
3
70
7
54
30
3
2
63
1.25
2906358--2906401
20
2.3
19
92
4
70
31
4
4
59
1.38
2906289--2906384
12
8.2
12
73
7
63
28
5
1
65
1.20
2906478--2906533
25
2.3
25
84
3
69
42
14
0
42
1.45
2906601--2906658
14
4.3
14
79
16
59
37
3
1
56
1.26
2906632--2906692
21
3.0
20
86
11
79
29
8
1
60
1.35
2906731--2906769
19
2.1
19
85
9
53
28
0
5
66
1.12
2906753--2906820
15
4.6
15
75
15
61
30
2
4
61
1.30
2906839--2906895
22
2.6
22
83
8
64
36
3
1
57
1.26
2906857--2906895
18
2.2
18
90
0
60
38
0
0
61
0.96
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13
7.1
12
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13
56
33
3
4
58
1.34
2907137--2907199
13
5.2
13
71
22
57
36
1
6
55
1.35
2907131--2907204
34
2.2
32
79
15
80
39
1
5
54
1.32
2907136--2907185
23
2.3
23
89
6
77
38
2
6
54
1.37
2907235--2907297
24
2.6
24
83
11
76
38
4
4
52
1.44
2907365--2907436
25
2.8
27
80
6
87
34
6
5
52
1.52
2907425--2907467
19
2.3
20
85
14
58
34
0
6
58
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2908990--2909047
26
2.2
26
93
0
98
34
5
24
36
1.78
2909031--2909061
14
2.2
14
100
0
62
38
6
12
41
1.69
2914731--2914788
26
2.2
26
93
0
98
34
5
24
36
1.78
2914772--2914802
14
2.2
14
100
0
62
38
6
12
41
1.69
2918987--2919022
18
1.9
19
88
5
56
33
27
0
38
1.57
2920641--2920676
17
2.2
17
90
5
56
47
11
11
30
1.74
2921002--2921026
10
2.5
10
100
0
50
72
8
0
20
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3.0
14
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6
50
64
0
4
30
1.14
2923880--2923914
14
2.6
13
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62
0
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1.18
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4
9.0
4
93
0
63
75
2
0
22
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325