Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  316  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95801555--95801604
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19
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0
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49
0
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1
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2.7
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0
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24
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4.9
9
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0
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22
4
22
50
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
161
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1.88
95856687--95856815
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1.9
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1.71
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1.22
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28
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0
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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281
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0
0
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6
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2.8
27
84
5
93
31
9
0
59
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95961554--95961639
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1.37
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44
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0
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0
0
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114
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3
60
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0
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46
91
1
444
38
15
24
21
1.92
95969916--95970234
137
2.3
138
88
1
462
38
15
24
21
1.92
95969916--95970244
183
1.8
182
84
2
446
38
15
23
22
1.93
95973200--95973232
2
17.0
2
93
6
59
48
0
0
51
1.00
95973754--95973796
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2.0
21
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13
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67
6
0
25
1.15
95976550--95976592
11
3.8
11
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17
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32
2
0
65
1.06
95976671--95976723
26
2.0
26
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0
106
28
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7
52
1.64
95984738--95984774
18
2.0
19
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5
58
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5
0
59
1.20
95986584--95986622
17
2.3
17
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0
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0
5
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1.05
95988085--95988130
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20
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8
4
45
1.55
95989523--95989563
21
2.0
21
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9
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60
0
0
39
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95989521--95989563
22
2.0
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13
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60
0
0
39
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95990775--95990846
34
2.1
34
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0
135
56
11
9
22
1.62
95990774--95990858
34
2.5
33
88
3
134
51
9
11
27
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95992125--95992183
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2.0
29
96
0
109
37
22
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33
1.80
95994434--95994616
92
2.0
92
91
3
298
47
15
8
28
1.75
95997406--95997451
20
2.3
20
89
10
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47
0
0
52
1.00
95998122--95998187
33
2.0
33
90
0
105
37
9
24
28
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2.3
25
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3
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1.36
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20.0
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0
0
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0
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0
0.78
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1.95
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2.4
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1.93
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331
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0
543
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2.0
45
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15
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2.3
25
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3
5
60
1.36
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31
2.1
31
88
5
96
35
6
6
52
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96027047--96027076
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5.0
6
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0
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0
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12
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0
59
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0
20
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1.9
104
90
0
321
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2.4
25
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50
1
1
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0
0
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1.75
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84
2.0
83
86
3
230
35
16
7
41
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325