Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  187  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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4.0
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25
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19
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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28
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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22
19
36
1.95
57766248--57766438
45
4.3
45
73
12
171
21
22
19
35
1.96
57766126--57766446
131
2.5
131
92
1
527
22
19
21
36
1.95
57766602--57766715
43
2.6
42
80
5
129
21
21
23
33
1.97
57767281--57767321
20
2.0
20
100
0
82
19
14
19
46
1.84
57774013--57774073
2
30.5
2
80
12
72
50
1
1
45
1.21
57774618--57774682
25
2.8
22
73
13
58
63
4
3
29
1.30
57776716--57776789
6
12.3
6
100
0
148
50
16
0
33
1.45
57782653--57782754
37
2.6
38
75
20
95
57
4
4
32
1.41
57782832--57782871
2
20.0
2
94
0
71
50
2
0
47
1.14
57782836--57782878
8
5.4
8
94
0
50
48
4
2
44
1.36
57782957--57783019
33
1.9
33
83
6
83
50
1
7
39
1.41
57791979--57792211
78
3.0
75
79
10
238
33
19
17
30
1.95
57792011--57792234
78
2.9
78
84
7
260
33
19
17
29
1.95
57792239--57792380
74
1.9
75
85
5
198
29
23
16
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57792074--57792641
168
3.4
167
89
1
859
31
20
19
29
1.97
57792577--57792969
63
6.0
63
78
9
410
27
24
17
30
1.97
57792563--57793193
135
4.6
136
84
8
719
30
22
17
29
1.97
57792930--57793373
71
5.8
76
78
13
421
34
18
17
29
1.94
57792931--57793209
77
3.7
74
88
7
379
34
20
17
27
1.95
57792907--57793437
155
3.4
150
79
11
470
33
19
17
29
1.95
57793155--57793437
159
1.8
155
83
6
372
33
18
17
31
1.94
57793471--57793784
76
4.2
73
83
8
359
33
20
17
29
1.95
57793510--57793871
76
4.7
75
79
13
400
34
19
15
30
1.93
57793089--57794118
417
2.5
410
81
9
1111
35
18
16
29
1.93
57793703--57793871
88
1.9
86
89
2
257
37
17
14
29
1.90
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13
3.4
13
78
6
54
71
4
8
15
1.28
57793879--57794046
73
2.3
74
85
1
221
35
19
16
29
1.94
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2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
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2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
57804798--57804831
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
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21
2.1
21
83
8
54
59
0
9
31
1.29
57812703--57812745
22
2.0
21
86
4
59
25
27
2
44
1.66
57813819--57813945
66
1.9
67
91
1
211
46
6
25
21
1.75
57815106--57815205
27
3.7
28
80
9
100
40
19
10
31
1.84
57815190--57815250
27
2.3
27
85
0
77
32
29
8
29
1.86
57815147--57815539
81
4.9
81
74
4
236
32
22
9
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57815201--57815411
27
7.8
27
89
2
289
27
24
9
38
1.85
57815336--57815612
27
10.2
27
77
9
134
37
19
8
34
1.82
57815405--57815665
81
3.2
81
74
10
226
40
19
9
31
1.83
57815404--57815640
27
8.7
27
75
8
203
40
19
8
32
1.81
57815659--57815736
27
2.9
27
77
11
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35
21
20
21
1.96
57816896--57816943
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
57816982--57817038
9
5.9
9
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15
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8
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1.84
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3.5
20
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0
124
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11
5.4
11
70
16
55
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12
20
30
1.90
57817097--57817213
48
2.4
47
91
5
182
26
20
23
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          321   322   323   324   325