Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  258  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80652193--80652224
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50
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12
2.6
13
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50
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6
18
1.70
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1.96
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3.3
39
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4
163
23
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25
23
1.99
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2.7
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2.5
70
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10
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2.0
39
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29
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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399
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19
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1.98
80774950--80775307
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2.6
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391
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19
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1.98
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1.99
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94
1.8
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91
0
281
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20
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1.99
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181
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20
27
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20.0
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0
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5.4
49
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10
191
25
28
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
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22
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19
1.98
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5.6
40
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26
27
20
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1.99
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26
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1.99
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1.98
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1.99
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1.98
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1.95
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0
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2.0
21
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1.94
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51
34
20
0
44
1.52
80873249--80873287
14
2.6
16
88
8
55
33
23
2
41
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80880809--80881026
39
5.5
40
95
2
372
22
23
27
26
2.00
80880809--80881026
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1.8
118
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26
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2.1
25
100
0
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1.69
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28
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1
169
32
26
12
27
1.92
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327
22
23
28
26
1.99
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2.6
21
84
0
63
38
5
31
24
1.78
80900275--80900323
21
2.3
22
76
16
59
42
4
14
38
1.64
80905040--80905176
23
5.8
23
76
10
109
26
22
17
33
1.96
80905018--80905154
68
1.9
72
84
10
185
25
21
16
35
1.95
80905132--80905183
26
2.0
25
85
3
68
26
25
21
26
1.99
80905325--80905400
20
3.8
19
77
14
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32
7
19
39
1.81
80906702--80906746
12
3.6
13
77
16
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55
0
4
40
1.20
80907118--80907146
9
3.2
9
100
0
58
62
0
13
24
1.32
80907889--80908081
50
3.8
51
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8
153
30
11
19
38
1.87
80914715--80914901
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
80914738--80914901
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
80914738--80914935
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
80922285--80922471
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
80922308--80922471
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
80922308--80922505
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80924571--80924615
12
3.6
13
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16
51
55
0
4
40
1.20
80924992--80925020
9
3.2
9
100
0
58
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0
13
24
1.32
80928159--80928374
40
5.5
40
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4
226
23
28
24
24
2.00
80936244--80936489
40
6.2
40
85
4
286
24
28
23
23
2.00
80936232--80936489
79
3.3
79
82
5
272
23
28
24
23
2.00
80938445--80938557
27
4.2
27
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3
129
16
23
23
36
1.94
80938443--80938557
54
2.1
54
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16
23
23
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1.94
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19
2.0
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1.61
80939651--80939687
18
2.1
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22
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3
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1.33
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7
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0
0
40
0.97
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2.4
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1
189
43
4
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32
1.70
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2.1
16
100
0
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0
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19
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2
2
24
1.10
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28
2.6
27
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1
1
26
1.03
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8
10.5
8
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70
2
2
25
1.09
80954118--80954197
36
2.2
37
82
10
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2
2
27
1.16
80954136--80954197
19
3.4
18
79
16
74
66
1
1
30
1.11
80954376--80954482
37
2.9
36
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10
101
33
1
0
64
1.04
80954423--80954483
28
2.2
28
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2
97
31
0
0
68
0.89
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19
2.8
20
82
5
74
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80954414--80954484
9
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10
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28
0
0
71
0.86
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8
10.4
9
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24
51
32
1
0
65
0.99
80954387--80954484
10
10.4
10
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22
52
32
1
0
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0.99
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15
2.5
15
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0
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1.90
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2.0
26
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0
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11
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0
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46
3.6
47
75
13
164
29
28
19
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325