Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  300  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Indels
Score
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1.9
166
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10
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2.0
20
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5
17
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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55
35
0
0
64
0.94
91958545--91958610
25
2.6
25
80
7
71
36
6
0
57
1.23
91964402--91964458
7
8.6
7
76
16
59
84
0
12
3
0.75
91964402--91964458
20
2.9
19
87
10
80
84
0
12
3
0.75
91965331--91965510
44
4.1
44
75
8
168
31
14
25
29
1.95
91965502--91966095
119
5.0
119
95
0
1026
33
18
18
29
1.95
91966019--91966452
83
5.2
83
96
0
789
32
20
20
26
1.97
91966019--91966452
165
2.6
166
96
0
789
32
20
20
26
1.97
91966838--91966944
35
3.0
35
91
4
169
40
10
13
36
1.78
91966838--91966944
17
5.9
18
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6
137
40
10
13
36
1.78
91967250--91967283
12
2.9
11
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12
50
35
0
0
64
0.94
91967251--91967359
21
5.3
21
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20
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36
2
0
59
1.18
91967248--91967278
16
2.0
16
93
6
55
35
0
0
64
0.94
91967384--91967453
26
2.7
25
76
8
68
38
5
0
55
1.24
91970594--91970859
46
5.9
46
87
7
359
22
23
16
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91970615--91970859
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2.8
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89
5
343
22
23
15
37
1.93
91973271--91973338
30
2.3
30
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5
84
27
19
4
48
1.68
91982224--91982255
5
6.6
5
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7
57
18
0
0
81
0.70
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9
3.7
9
92
7
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20
0
0
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0
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1.91
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35
2.1
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100
0
146
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1.75
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18
0
0
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0.70
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1.9
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48
1.65
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0
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0
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1.47
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3.1
18
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22
0
32
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1.53
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2.0
51
100
0
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2
20.5
2
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0
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0
0
51
1.00
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20
1.94
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18
2.0
18
100
0
72
38
16
5
38
1.72
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18
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34
2
2
61
1.20
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1.9
65
81
10
151
31
4
2
60
1.31
92011928--92011972
18
2.5
18
85
7
56
28
2
2
66
1.15
92022179--92022220
20
2.1
20
100
0
84
42
0
19
38
1.51
92022183--92022229
20
2.3
20
92
0
76
40
2
23
34
1.67
92024571--92026266
564
3.0
564
99
0
3367
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11
17
35
1.86
92035892--92035934
2
21.0
2
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4
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48
0
2
48
1.14
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7
3.9
7
100
0
54
0
11
0
88
0.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92045846--92045893
24
2.0
24
95
0
87
58
10
10
20
1.60
92045904--92045962
26
2.3
25
80
8
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62
1
10
25
1.36
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3
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3
100
0
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0
0
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2.0
30
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0
100
25
47
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20
1.74
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25
2.8
26
80
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92
36
7
2
53
1.43
92046920--92046984
14
4.6
14
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4
1
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2.9
23
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5
5
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0
18
0
0.70
92060163--92060196
11
3.1
11
87
12
52
79
0
20
0
0.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325