Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  3  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
609515--609548
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0
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0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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23
11
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4.6
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167
32
11
23
32
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14
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35
4.6
35
84
8
192
33
24
10
31
1.90
697283--697453
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2.4
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83
9
217
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1.90
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29
20
20
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705311--705481
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2.4
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9
205
32
10
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20
2.4
21
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3.0
89
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1
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17
19
22
40
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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19
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25
7
0
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1.24
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13
114
25
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1
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1.28
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12
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10
0
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725988--726124
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0
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2
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2.1
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51
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0
0
36
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
739367--739399
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0
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1.24
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0
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12
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57
0
2
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4
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0
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0
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0
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0
96
41
16
20
20
1.90
754746--754802
30
1.9
29
86
10
80
38
0
1
59
1.08
755002--755053
16
3.1
16
72
20
52
57
13
0
28
1.36
755189--755231
15
2.9
15
86
6
52
41
4
0
53
1.21
756638--756700
25
2.4
27
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7
78
58
3
11
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1.9
16
93
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53
56
0
6
36
1.26
757342--757392
26
2.0
26
84
7
68
52
7
9
29
1.62
759975--760008
10
3.6
10
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7
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44
5
5
44
1.52
760952--760976
12
2.1
12
100
0
50
24
8
40
28
1.83
767680--767855
46
3.8
45
78
10
194
21
18
29
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
1.8
93
92
0
290
20
19
30
29
1.97
770272--770310
20
2.0
20
100
0
78
51
2
5
41
1.38
775088--775402
141
2.3
138
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2
461
36
16
8
39
1.79
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62
2.0
62
100
0
244
27
29
7
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2.0
16
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0
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0
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2.0
17
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0
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0
0
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3.0
42
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35
1.76
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2
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2
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0
92
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1
0
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1.11
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1.9
20
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0
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0
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1.25
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2.0
85
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18
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27
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32
18
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28
1.96
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27
2.7
28
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32
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28
1.95
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2
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48
0
0
51
1.00
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2.4
58
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4
183
43
0
3
52
1.23
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2.0
29
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0
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16
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24
26
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1.79
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39
2.2
39
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0
154
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5
22
17
1.64
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29
2.0
29
100
0
118
42
6
10
40
1.65
822064--822130
32
2.2
29
82
10
73
52
1
4
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1.31
824665--824708
20
2.1
21
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9
0
29
1.27
830042--830097
28
2.0
29
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3
69
51
16
16
16
1.76
832583--832613
14
2.2
14
94
0
53
61
12
6
19
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
833946--833970
6
4.2
6
100
0
50
32
20
32
16
1.94
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17
2.0
17
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0
50
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0
0
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2.3
17
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2
0
64
1.08
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1.9
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16
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0
36
1.25
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19
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65
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2
0
36
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17.0
3
100
0
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0
0
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2.5
25
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26
100
0
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1.83
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19
2.2
19
95
4
73
40
15
15
30
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325