Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  48  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12149068--12149111
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2
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1.09
12150489--12150537
25
1.9
26
88
12
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38
2
0
59
1.09
12157243--12157334
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9.8
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0
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12157272--12157407
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66
0
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27
1.17
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.9
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93
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20
1.98
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1.98
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5
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5
0
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27
2.6
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122
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27
14
28
1.95
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46
2.7
46
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1.9
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24
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2.1
123
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282
23
24
14
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1.92
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41
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177
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1.92
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2.0
30
83
10
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0
3
39
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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30
18
25
1.98
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15.9
72
73
12
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15
31
1.93
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2.5
461
94
2
1976
33
19
15
31
1.93
12314258--12314761
225
2.2
223
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731
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19
15
33
1.92
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12
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1
0
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68
19
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10.5
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13
22
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2.1
214
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1.94
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1.60
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8.8
77
72
16
316
29
18
19
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12350945--12351721
165
4.8
165
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8
924
28
18
20
32
1.96
12351439--12351781
72
4.6
73
78
7
357
30
17
19
32
1.95
12351438--12352155
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76
72
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409
28
16
19
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1.93
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30
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30
90
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19
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29
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1.83
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2.3
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27
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18
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1.93
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2.3
16
90
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0
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0
0
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0
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51
1.17
12356717--12356773
21
2.8
20
74
10
53
21
3
8
66
1.34
12357541--12357576
19
1.9
18
88
5
54
27
13
13
44
1.82
12360224--12360264
21
2.0
21
90
0
64
14
2
12
70
1.26
12362779--12362812
17
2.0
17
88
0
50
47
0
0
52
1.00
12363340--12363373
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
12378044--12378374
48
6.9
47
79
5
306
29
18
28
23
1.98
12378044--12378375
144
2.3
145
88
3
474
29
18
28
23
1.98
12385806--12386133
144
2.3
144
85
3
428
29
18
27
24
1.98
12385815--12386132
48
6.6
48
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5
295
30
18
27
23
1.98
12387339--12387378
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21
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5
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12
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27
25
1.92
12390956--12391001
23
2.0
23
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8
58
30
2
0
67
1.03
12391213--12391239
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
12391370--12391711
41
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41
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0
452
33
22
24
19
1.97
12391869--12391966
7
13.4
7
72
8
52
27
1
24
46
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12391877--12391961
21
3.9
21
76
11
89
28
1
25
44
1.61
12391884--12391977
46
2.0
46
95
0
170
29
2
25
42
1.67
12392004--12392125
7
17.1
7
70
9
77
22
0
40
37
1.54
12393262--12393351
46
2.0
46
84
8
121
37
2
4
55
1.32
12393289--12393351
23
2.7
23
77
18
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38
0
6
55
1.25
12397394--12397426
12
2.8
12
100
0
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48
6
9
36
1.60
12397892--12397925
16
2.1
16
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10
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14
5
8
70
1.31
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2.7
11
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0
51
0
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0
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19
2.3
20
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40
0
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24
1.56
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11
257
25
19
26
29
1.98
12406555--12406830
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2.9
96
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302
25
19
25
29
1.99
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3.2
26
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0
150
34
5
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35
1.80
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26
2.0
26
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7
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37
22
15
24
1.92
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26
2.1
26
86
6
76
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14
23
1.92
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3.5
29
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0
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25
1.96
12422723--12422854
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2.3
58
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2
176
25
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15
24
1.95
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29
5.6
29
79
3
144
25
33
16
24
1.96
12432281--12432443
24
6.8
24
98
0
308
36
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17
20
1.94
12440213--12440351
24
5.8
24
98
0
260
35
26
17
20
1.94
12453529--12453588
30
2.0
30
90
0
93
28
25
8
38
1.84
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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17
2.0
17
100
0
68
58
5
17
17
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12463044--12463121
34
2.3
34
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0
111
37
20
1
41
1.61
12463056--12463125
34
2.1
34
94
0
122
37
20
1
41
1.61
12463280--12463434
43
3.6
42
73
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127
31
23
16
28
1.96
12471122--12471236
46
2.5
44
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144
27
19
27
25
1.98
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3.5
30
100
0
208
33
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25
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2.7
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14
150
30
19
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22
1.98
12482464--12482613
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3.2
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27
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1.98
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41
0
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1.55
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1.9
29
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3
85
16
21
47
14
1.82
12486858--12486897
21
2.0
20
90
5
62
10
40
30
20
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325