Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  34  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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13
29
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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205
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5
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24
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2.1
24
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8261494--8261552
24
2.6
22
82
10
73
33
3
23
38
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.21
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2.0
16
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0
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21
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1.71
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13
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25
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3
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1.31
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22
2.8
22
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2
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18
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6
68
1.33
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0
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1.93
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482
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15
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24
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19
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14
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8311868--8311972
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1.95
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97
1.9
97
92
0
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27
14
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1.95
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2.0
42
90
0
130
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15
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1.96
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14
1.9
14
100
0
54
0
7
0
92
0.38
8367556--8367587
2
16.0
2
100
0
64
50
50
0
0
1.00
8369242--8369275
12
2.7
13
86
9
52
41
5
5
47
1.52
8369242--8369273
13
2.4
14
90
10
50
40
3
6
50
1.43
8370315--8370344
16
1.9
15
93
6
51
90
0
10
0
0.47
8377261--8377391
43
3.1
43
73
5
122
30
22
16
30
1.96
8384096--8384137
22
1.9
22
85
9
59
9
9
2
78
1.05
8388619--8388659
19
2.2
19
100
0
82
60
14
9
14
1.57
8388959--8389132
43
4.1
43
71
12
133
31
22
16
29
1.96
8392927--8392974
24
2.0
24
95
0
87
37
18
12
31
1.88
8395167--8395233
3
22.7
3
96
3
127
67
0
0
32
0.91
8395300--8395406
14
8.2
13
67
13
60
72
0
4
22
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8395274--8395406
35
3.6
35
77
12
97
73
0
5
20
1.07
8395279--8395406
6
20.7
6
70
17
57
74
0
4
20
1.05
8395292--8395367
16
5.1
15
75
21
63
77
0
2
19
0.88
8395367--8395429
22
3.0
22
73
26
64
63
1
6
28
1.28
8395292--8395408
51
2.3
49
78
11
121
73
0
4
22
1.00
8395316--8395443
41
3.2
41
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13
126
71
0
3
25
1.06
8395292--8395437
15
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15
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0
4
23
1.07
8405553--8405585
2
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2
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0
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0
0
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1
374
45
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5
22
1.75
8432357--8432454
30
3.2
30
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13
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48
26
4
20
1.67
8433106--8433136
11
2.8
11
95
0
53
6
16
6
70
1.29
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1.9
20
89
5
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43
0
5
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1.24
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20
2.0
20
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0
53
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10
37
5
1.59
8457583--8457612
13
2.3
13
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0
51
10
46
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23
1.80
8457945--8458022
39
2.0
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30
17
23
28
1.97
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2
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2
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0
108
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0
0
50
1.00
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2.4
19
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55
0
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1.20
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22
2.3
21
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27
35
0
37
1.57
8468917--8468977
11
5.5
11
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21
32
0
45
1.52
8468989--8469044
25
2.2
25
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69
26
1
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64
1.29
8469142--8469168
5
5.4
5
100
0
54
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0
0
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34
2.0
34
94
0
120
42
13
13
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8479317--8479347
16
1.9
16
100
0
62
38
9
0
51
1.35
8479303--8479344
20
2.2
18
91
8
66
42
4
0
52
1.22
8481695--8481766
24
3.0
24
69
15
58
16
29
16
37
1.91
8481845--8481973
25
5.2
25
72
13
70
18
25
22
33
1.97
8484328--8484368
19
2.1
20
90
4
66
31
7
0
60
1.24
8484777--8484818
18
2.3
18
88
8
59
0
23
0
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0.79
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10
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1
20
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8484779--8484840
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27
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1
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0
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15
2.6
16
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7
50
2
4
7
85
0.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325