Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  42  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10362933--10362975
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2.0
22
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0
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0
2
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1.13
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0
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13
1.91
10368030--10368145
39
3.0
39
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0
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37
22
25
13
1.91
10369765--10369853
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2.0
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0
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2.2
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2.0
30
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0
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32
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2.5
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2
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20
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2.0
18
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4
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51
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10386177--10386221
21
2.2
21
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4
56
42
4
2
51
1.34
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2.1
30
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9
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3
52
1.34
10386304--10386370
28
2.4
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29
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59
1.41
10388721--10388806
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1.9
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127
32
15
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1.95
10388714--10388847
46
3.0
45
80
4
126
35
14
23
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10391345--10391447
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14
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10391367--10391452
46
1.9
44
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27
24
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1.95
10394599--10394640
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2.1
19
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19
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20.0
2
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0
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48
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6
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2.1
22
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44
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0
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2
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2.5
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2
100
0
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50
0
0
50
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2.0
21
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4
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2.0
41
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1.62
10425032--10425141
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3.1
35
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34
0
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1.53
10425180--10425447
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2.1
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396
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15
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1.88
10428325--10428558
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5.3
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25
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1.96
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3.8
177
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2
912
29
16
25
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10429471--10429503
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16
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24
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54
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3
2
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1.26
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1.9
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100
0
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0
0
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3
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59
1.35
10443407--10443691
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31
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58
1.42
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252
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16
17
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1.91
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220
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56
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20
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1.01
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2
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1.24
10457811--10458292
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164
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4
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1.37
10457639--10458153
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10473024--10473079
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1.03
10473014--10473079
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3.6
18
80
10
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66
0
1
31
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10483745--10483815
25
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22
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21
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59
1
0
39
1.06
10483768--10483831
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1.9
33
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1
0
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1.08
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0
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1.12
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0
50
52
0
0
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1.00
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11
13
23
1.73
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10
3.7
9
85
14
52
17
0
11
71
1.14
10498996--10499511
259
2.0
259
96
0
942
37
15
18
27
1.92
10509695--10509764
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
10509695--10509776
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
10516929--10516998
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
10516929--10517010
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
10518531--10518567
19
1.9
19
88
0
56
37
13
2
45
1.58
10519725--10519764
8
5.0
8
90
0
53
7
25
17
50
1.72
10522457--10522725
46
6.0
46
87
6
347
42
13
23
21
1.88
10522457--10522725
137
2.0
133
86
4
378
42
13
23
21
1.88
10529330--10529396
25
2.5
26
73
9
73
46
8
5
38
1.60
10529748--10529774
12
2.2
12
100
0
54
7
0
33
59
1.25
10529976--10530040
32
2.0
32
93
0
112
52
7
23
16
1.70
10534155--10534187
17
1.9
17
100
0
66
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10534360--10534453
44
2.1
44
88
4
134
35
26
5
32
1.79
10534435--10534490
16
3.5
16
92
0
94
28
30
7
33
1.84
10535169--10535198
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
10537247--10537273
14
1.9
14
100
0
54
74
0
11
14
1.08
10543832--10543977
26
5.6
26
94
0
247
33
5
23
36
1.78
10545761--10546181
136
3.1
136
97
0
788
24
18
24
32
1.97
10549945--10550104
26
6.2
26
93
2
270
33
5
25
36
1.77
10551577--10551628
25
2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
10551876--10552294
136
3.1
136
97
1
779
24
18
24
32
1.97
10551876--10552294
135
3.1
136
96
1
770
24
18
24
32
1.97
10554930--10555033
25
4.2
25
96
3
192
31
6
25
36
1.82
10554930--10555033
49
2.1
51
96
3
194
31
6
25
36
1.82
10558886--10558922
2
18.5
2
94
0
65
48
2
0
48
1.15
10559576--10559762
3
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3
78
10
168
30
5
3
60
1.34
10559846--10559890
3
15.0
3
95
0
81
35
0
0
64
0.94
10566730--10566765
18
2.0
18
94
0
63
33
19
27
19
1.96
10568433--10568495
31
2.0
31
100
0
126
39
15
15
28
1.89
10569244--10569383
48
2.9
48
92
0
235
27
26
20
25
1.99
10575559--10575797
48
5.0
48
91
0
352
27
18
23
29
1.98
10580890--10581029
27
5.2
28
88
5
175
35
22
25
17
1.96
10581445--10581474
16
1.9
15
93
6
51
3
20
23
53
1.60
10582639--10582721
26
3.2
26
93
3
141
36
24
4
34
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10582717--10582748
10
3.2
10
100
0
64
31
9
9
50
1.66
10586701--10586840
27
5.2
28
88
5
175
35
22
25
17
1.96
10588455--10588564
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
10588560--10588591
10
3.2
10
100
0
64
31
9
9
50
1.66
10589077--10589148
22
3.4
22
84
3
85
27
41
13
16
1.87
10589090--10589156
20
3.2
21
75
12
68
26
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13
13
1.80
10591460--10591504
23
2.0
23
81
0
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62
4
4
28
1.34
10591468--10591510
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2.0
21
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2
4
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1.32
10592148--10592254
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2.0
52
80
8
119
30
18
16
33
1.94
10595544--10595585
23
1.9
21
85
9
57
52
11
0
35
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325