Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  75  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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214
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27
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13
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0
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33
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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2.8
28
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72
25
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15
2.1
15
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2.4
29
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52
1.44
20972594--20972666
30
2.4
29
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38
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1.44
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228
92
0
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19
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.18
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2.0
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4
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0
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26
20
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1.99
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1.99
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24
2.0
24
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36
28
12
22
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21037761--21037952
39
4.9
39
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133
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29
20
20
1.98
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78
2.1
78
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28
29
20
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1.98
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39
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19
21
1.98
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35
14
24
25
1.93
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14
24
24
1.93
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47
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1.97
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2.3
138
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15
324
23
28
17
30
1.97
21050288--21050319
15
2.1
15
94
0
55
68
3
6
21
1.26
21052266--21052300
16
2.1
17
94
5
63
34
17
0
48
1.47
21071724--21071768
23
2.0
23
82
8
56
22
13
0
64
1.28
21093855--21094053
42
4.7
42
76
8
170
33
25
16
25
1.96
21100440--21100477
19
2.0
20
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15
53
39
23
0
36
1.55
21100707--21100877
93
1.8
93
91
0
279
28
28
21
21
1.98
21100702--21100874
46
3.7
46
77
10
190
29
27
20
21
1.98
21100754--21100893
46
3.0
45
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29
28
19
22
1.98
21107546--21107583
19
2.0
20
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28
28
21
22
1.99
21107812--21107981
92
1.8
92
91
1
277
28
28
21
21
1.99
21107858--21107997
46
3.0
45
74
18
128
29
28
19
22
1.98
21116371--21116396
7
3.7
7
100
0
52
11
0
0
88
0.52
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2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21124365--21124419
27
2.0
28
92
3
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3
20
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1.28
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4
7.5
4
100
0
60
50
0
23
26
1.50
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17
2.1
18
94
5
65
86
0
13
0
0.58
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27
2.0
27
85
0
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16
27
20
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1.94
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27
2.3
27
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0
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16
26
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1.94
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17
2.7
17
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9
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2
23
0
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0.94
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2
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2
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46
0
0
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1.00
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1.73
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34
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0
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0
0
50
1.00
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0
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0
0
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20
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7
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2
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2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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3.4
14
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32
34
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19
1.90
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7
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13
15
1.86
21178895--21178932
20
1.9
20
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0
58
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15
1.90
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3
100
0
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0
0
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0.92
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4
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0
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50
0
0
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1.00
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3
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3
100
0
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0
0
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0.92
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2.1
17
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0
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37
5
17
40
1.73
21189463--21189544
26
3.2
26
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0
137
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7
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37
1.82
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26
2.0
25
82
13
63
39
22
11
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21194150--21194208
26
2.3
26
90
0
91
30
11
13
44
1.80
21210569--21210611
15
2.9
15
92
0
68
16
13
13
55
1.69
21210931--21210960
15
2.0
15
93
0
51
23
6
23
46
1.75
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4.7
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27
26
2.00
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1.9
21
85
10
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30
25
20
25
1.99
21225511--21225562
25
2.3
22
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17
5
15
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1.52
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2.0
25
100
0
100
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4
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2.9
178
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0
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19
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1.87
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16
2.2
16
94
0
61
20
14
45
20
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325