Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  23  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5371141--5371227
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4
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3
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1.30
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2.3
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18
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19
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1.9
54
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1.9
209
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2
1508
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1.9
192
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38
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5383821--5384083
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1.9
141
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2.0
27
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58
1
7
32
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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116
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0
0
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19
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5
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23
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1.00
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17
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3
0
33
1.10
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34
2.0
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15
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1.9
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4.2
26
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0
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41
14
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20
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2.9
92
89
1
386
41
14
23
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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138
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1.87
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5
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19
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1.19
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17
2.3
17
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8
53
17
10
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1.00
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29
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136
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0
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0
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47
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2
156
30
25
15
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5458379--5458407
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4.1
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100
0
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13
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26
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259
26
26
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50
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257
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19
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17
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2
0
38
1.13
5485841--5485896
26
2.1
27
83
9
71
30
1
5
62
1.28
5489667--5489757
32
2.8
33
88
11
136
74
15
6
3
1.15
5489796--5489825
12
2.5
12
100
0
60
10
43
0
46
1.37
5490249--5490305
29
2.0
29
82
6
71
22
10
7
59
1.54
5490548--5490577
11
2.7
11
89
0
51
40
0
0
60
0.97
5496951--5497044
25
3.8
25
69
4
75
22
27
17
32
1.96
5497533--5497621
40
2.1
43
84
12
114
58
1
3
37
1.22
5498510--5498620
37
2.8
38
75
10
107
26
15
21
36
1.93
5498836--5498864
14
2.0
15
93
6
51
27
3
20
48
1.66
5500527--5500586
3
20.0
3
77
6
59
68
3
1
26
1.15
5500507--5500545
15
2.6
15
83
0
51
61
5
7
25
1.44
5502350--5503515
44
25.6
44
69
10
502
30
20
16
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5502740--5502925
95
2.0
95
81
4
223
30
19
15
33
1.93
5502751--5503064
139
2.2
140
80
7
359
30
18
15
34
1.93
5503044--5503513
133
3.5
131
75
8
415
31
22
15
30
1.95
5502992--5503515
89
5.8
87
70
10
268
30
22
15
31
1.95
5510559--5510738
67
2.8
64
76
9
177
30
16
29
23
1.96
5513720--5513750
15
2.1
15
100
0
62
12
12
48
25
1.77
5515820--5515875
25
2.2
25
78
6
60
50
3
5
41
1.43
5515845--5515944
39
2.6
39
77
4
105
54
4
6
36
1.44
5516400--5516490
34
2.7
34
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6
132
5
6
15
72
1.24
5517137--5517568
88
5.0
85
69
16
282
37
18
16
27
1.93
5517316--5517377
30
2.1
30
87
6
90
40
27
11
20
1.87
5517642--5517812
92
1.8
94
85
5
240
33
19
18
28
1.96
5517736--5518038
75
4.0
76
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6
400
32
21
16
29
1.95
5517148--5517983
253
3.4
245
83
8
834
35
18
16
28
1.93
5518007--5518112
54
1.9
54
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9
144
37
19
15
27
1.92
5517889--5518294
220
1.9
209
85
6
562
37
20
16
25
1.93
5518103--5518266
70
2.3
71
87
7
244
41
20
15
22
1.90
5518143--5518642
121
4.0
121
76
14
498
38
22
14
25
1.92
5518266--5518527
70
3.8
70
83
6
336
38
22
14
25
1.91
5518106--5518693
261
2.3
255
93
4
1002
37
22
14
25
1.93
5518266--5518527
140
1.9
140
88
3
402
38
22
14
25
1.91
5527121--5527221
43
2.6
37
75
20
91
58
4
3
32
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5527403--5527465
33
1.9
33
83
6
83
50
1
7
39
1.41
5527955--5528051
32
3.0
32
85
10
117
6
6
13
74
1.20
5527957--5528037
35
2.3
34
87
8
117
4
7
9
77
1.10
5540199--5540284
35
2.6
35
85
12
103
36
11
12
39
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5546174--5546237
3
22.0
3
75
9
53
65
3
3
28
1.23
5546355--5546428
17
3.9
18
77
12
51
67
6
4
21
1.31
5550044--5550120
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1.9
40
86
0
109
14
15
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36
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5555521--5555546
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8
100
0
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11
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4.1
40
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22
109
36
18
22
22
1.95
5555889--5556022
70
1.9
68
89
8
209
38
18
23
20
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325