Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  45  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11161851--11161908
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60
0
1
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1.08
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2
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11162165--11162301
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20
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116
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4.7
40
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2
299
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22
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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26
25
2.00
11222088--11222301
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2.00
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140
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18
28
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
52
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1.98
11323846--11324012
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241
28
18
28
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1.98
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30
28
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50
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2.7
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9
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66
0
2
31
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11341747--11341802
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0
0
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2.2
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11360363--11360402
21
2.0
21
85
5
55
35
2
2
60
1.24
11360483--11360511
15
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
11364445--11364497
26
2.0
26
96
0
97
49
18
5
26
1.70
11365526--11365647
41
2.8
43
80
11
122
27
18
26
27
1.98
11365575--11365730
41
3.6
41
74
15
143
27
20
26
25
1.99
11365572--11365730
42
3.6
44
74
15
141
27
20
26
25
1.99
11365572--11365739
89
1.9
90
86
1
239
26
21
26
26
1.99
11379356--11379513
43
3.7
43
81
5
167
32
24
14
27
1.94
11380639--11380666
12
2.3
12
100
0
56
21
21
17
39
1.93
11388416--11388460
4
11.8
4
79
15
51
24
0
4
71
1.05
11390021--11390121
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
11395584--11395648
21
3.1
21
79
0
85
38
24
20
16
1.93
11397081--11397116
15
2.3
17
81
18
51
0
30
0
69
0.89
11403443--11403507
21
3.1
21
79
0
85
38
24
20
16
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11405460--11405497
15
2.4
17
83
16
55
0
28
0
71
0.87
11406399--11407468
533
2.0
535
96
2
1979
40
18
8
32
1.81
11408003--11408067
21
3.1
21
79
0
85
38
24
20
16
1.93
11409493--11409528
15
2.3
17
81
18
51
0
30
0
69
0.89
11414546--11414588
18
2.5
17
78
17
52
18
25
6
48
1.73
11415845--11415909
21
3.1
21
76
8
78
40
24
18
16
1.91
11417343--11417378
15
2.3
17
81
18
51
0
30
0
69
0.89
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12
2.1
12
100
0
50
8
32
8
52
1.60
11420474--11420577
27
3.9
27
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0
172
39
14
13
32
1.85
11420475--11420600
54
2.3
54
83
5
157
38
13
14
33
1.85
11420586--11420655
27
2.6
27
84
6
88
40
17
20
22
1.92
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18
2.7
19
78
9
68
22
22
18
38
1.94
11422066--11422123
22
2.6
22
77
0
53
39
13
24
22
1.90
11428329--11428358
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
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93
1.8
93
91
0
279
28
28
21
22
1.99
11442854--11443029
46
3.8
46
78
10
178
29
27
20
22
1.98
11448160--11448206
24
2.0
24
100
0
94
25
17
25
31
1.97
11453669--11453947
25
11.2
25
72
13
225
37
25
13
22
1.92
11453664--11453947
50
5.7
50
88
1
356
37
25
13
23
1.92
11453668--11453901
75
3.1
75
80
7
285
37
26
14
22
1.92
11459696--11459810
26
4.5
26
75
12
96
32
22
26
18
1.97
11460774--11460801
13
2.2
13
100
0
56
21
14
0
64
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11462954--11463131
89
2.0
89
96
0
329
37
11
22
28
1.90
11463812--11463863
22
2.4
23
87
12
76
28
28
17
25
1.97
11470892--11470959
34
2.0
34
97
0
127
23
8
4
63
1.42
11472046--11472135
45
2.0
45
95
0
162
41
12
8
37
1.74
11475154--11475187
17
2.0
17
94
0
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50
0
0
50
1.00
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14
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14
100
0
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59
3
0
37
1.15
11508669--11508725
2
28.5
2
100
0
114
50
0
0
49
1.00
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1.9
92
93
0
297
28
29
20
21
1.98
11510786--11510960
46
3.8
46
80
8
212
29
29
20
21
1.98
11510791--11510979
46
4.1
44
71
20
120
29
28
20
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325