Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  315  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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76
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0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
95638826--95638978
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24
4.5
24
79
9
117
32
25
41
0
1.62
95645262--95645320
31
1.9
31
89
0
91
15
8
18
57
1.63
95645389--95645519
43
3.0
43
90
0
190
28
31
15
25
1.95
95645494--95645545
26
2.0
26
88
7
79
19
28
19
32
1.96
95645453--95645588
69
2.0
69
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2
175
25
31
14
27
1.95
95656105--95656147
17
2.5
18
81
11
54
53
0
11
34
1.37
95661606--95661641
17
2.2
17
90
5
56
38
0
13
47
1.44
95673406--95673817
213
1.9
213
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1
709
35
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16
26
1.94
95678353--95678475
38
3.2
38
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2
147
21
21
26
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1.99
95678493--95678555
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27
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1.80
95678520--95678606
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2.0
43
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0
147
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1.91
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43
2.1
43
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0
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14
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33
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1.94
95678944--95679061
45
2.7
44
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7
127
27
22
26
23
1.99
95685655--95685680
12
2.2
12
100
0
52
46
0
0
53
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95687127--95687156
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2.3
13
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0
51
30
6
6
56
1.51
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11
2.8
12
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4
50
51
12
3
33
1.54
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21
2.0
21
95
0
75
40
16
0
42
1.48
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27
5.9
27
80
14
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35
22
23
18
1.96
95693284--95693442
54
3.0
54
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6
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35
22
23
18
1.96
95693659--95693717
28
2.1
28
100
0
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32
32
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22
1.92
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3.2
26
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0
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22
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1.82
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2.0
73
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0
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10
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1.55
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24
5.1
24
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2
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27
20
20
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1.98
95711190--95711314
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48
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3
187
27
20
20
31
1.98
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20
3.3
20
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0
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1.90
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2.8
24
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9
23
1
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1.29
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17
2.1
17
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10
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14
29
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1.81
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38
1.9
39
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2
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48
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1.72
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13
3.2
13
79
0
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38
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35
1.81
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2.0
42
100
0
170
40
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1.76
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14
3.1
14
78
15
56
64
0
2
33
1.06
95728722--95728760
19
2.1
19
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0
51
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0
2
30
1.05
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15
2.3
15
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5
50
66
3
0
30
1.06
95742721--95742871
53
2.8
53
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4
214
25
16
27
29
1.97
95749583--95749733
53
2.8
53
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205
25
17
27
29
1.97
95751594--95751665
22
3.0
24
72
12
76
33
19
26
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95757343--95757410
29
2.3
29
100
0
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27
30
20
1.98
95760033--95760462
67
6.4
67
79
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456
24
23
16
34
1.95
95760033--95760462
201
2.1
200
83
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521
24
23
16
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1.95
95763216--95763323
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2.4
44
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128
28
24
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11
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0
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16
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2.0
104
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117
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51
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0
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16
2.8
16
90
6
65
28
0
30
41
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325