Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  100  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29470749--29470793
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2
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0
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1.96
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3.5
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0
150
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33
23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.2
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1.91
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1.94
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1.96
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25
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2.0
22
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18
43
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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39
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129
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14
26
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29620386--29620486
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35
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129
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22
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344
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21
22
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0
69
25
16
25
33
1.96
29625218--29625242
11
2.3
11
100
0
50
52
8
16
24
1.70
29628667--29628708
21
2.0
20
86
4
57
21
19
21
38
1.94
29630871--29630968
39
2.6
38
81
1
115
28
6
22
42
1.77
29645733--29645782
24
2.1
24
84
0
64
60
4
2
34
1.27
29645895--29645940
23
2.0
23
100
0
92
39
13
8
39
1.75
29646385--29646409
10
2.5
10
100
0
50
0
0
48
52
1.00
29647305--29647360
5
11.2
5
86
5
60
26
0
0
73
0.84
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21
2.1
21
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0
0
73
0.84
29649277--29649340
32
2.0
32
100
0
128
21
28
18
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1.97
29651369--29651544
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21
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1.98
29651366--29651536
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1.8
93
91
0
279
21
20
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28
1.98
29656758--29656794
17
2.2
17
100
0
74
59
13
5
21
1.54
29660533--29660693
29
5.6
29
90
0
223
29
14
31
24
1.95
29660529--29660713
87
2.1
87
80
1
219
29
15
31
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29668625--29668774
57
2.6
57
87
3
203
30
16
28
25
1.96
29668625--29668783
29
5.6
29
87
3
205
28
15
30
25
1.96
29677749--29677780
2
16.0
2
93
0
55
46
0
3
50
1.17
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35
2.0
35
94
0
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27
24
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1.95
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13
4.0
13
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15
54
11
18
1.70
29682575--29682729
3
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3
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2
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29683124--29683162
19
2.1
19
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0
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1.62
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22
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0
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0
0
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11
0
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0
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0
0
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1.9
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0
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1.80
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129
48
14
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16
1.81
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4.2
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430
27
16
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2.0
18
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26
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18
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160
2.9
160
86
2
601
28
16
19
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1.9
72
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27
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29696417--29696584
88
1.9
88
82
2
212
28
16
20
35
1.94
29697046--29697093
25
1.9
25
86
0
69
31
27
10
31
1.90
29697276--29697315
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3.0
13
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15
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20
1.74
29698197--29698363
3
56.0
3
73
11
112
31
4
2
62
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29698594--29698667
11
6.6
11
71
20
55
39
1
4
55
1.27
29698589--29698667
32
2.5
32
82
9
92
39
1
3
55
1.26
29698626--29698672
24
1.9
24
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1.36
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19
2.1
19
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0
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1.62
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13
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30
11
0
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2
100
0
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0
0
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2.0
406
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0
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39
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1
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24
31
20
23
1.98
29723518--29723669
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1.9
79
94
1
270
23
31
20
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325