Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  241  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75564536--75564699
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0
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1.98
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1.8
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251
28
27
17
26
1.98
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2.2
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125
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2
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.99
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1.9
80
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183
22
30
24
22
1.99
75625671--75625778
40
2.7
38
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8
128
21
29
25
23
1.99
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24
1.98
75633812--75634000
38
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21
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22
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1.98
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1.98
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1.9
80
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2
183
22
30
24
22
1.99
75661740--75661847
40
2.7
38
85
8
128
21
29
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1.99
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22
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45
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21
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38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.98
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15
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11
18
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1.65
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2.7
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20
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1.94
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648
38
12
15
33
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75738099--75738199
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28
86
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114
29
13
26
29
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151
25
20
28
25
1.99
75761532--75761566
17
2.0
18
88
5
54
51
11
2
34
1.53
75762808--75762842
6
5.8
6
100
0
70
51
0
31
17
1.45
75765555--75765594
20
2.0
20
100
0
80
50
10
15
25
1.74
75765731--75765787
30
1.9
30
92
0
96
36
10
21
31
1.87
75773184--75773302
43
2.8
42
80
2
139
28
25
14
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1.94
75783375--75783560
89
2.1
89
97
0
354
34
8
17
39
1.80
75783902--75783950
25
2.0
24
84
4
62
20
4
0
75
0.96
75784942--75785230
99
2.9
98
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4
404
29
14
23
32
1.94
75787134--75787192
24
2.5
24
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5
68
37
18
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22
1.94
75787158--75787248
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25
1.98
75787161--75787248
46
1.9
45
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2
140
29
20
23
26
1.99
75794825--75794941
24
4.9
24
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12
80
34
17
20
27
1.95
75794897--75794961
23
2.8
23
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6
69
32
20
21
26
1.97
75796544--75796616
26
2.8
26
91
0
119
39
10
19
30
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75799658--75799700
10
4.1
10
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11
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53
27
2
16
1.55
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43
2.0
42
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2
121
34
22
15
26
1.94
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85
1.8
85
81
8
192
32
25
17
25
1.97
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2
20.5
2
100
0
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0
0
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16
0
6
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0.99
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2
20.5
2
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0
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0
0
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1.00
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2.0
35
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0
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11
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1.91
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28
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26
1.99
75821975--75822315
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2.5
135
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19
24
26
1.99
75821975--75822315
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29
19
24
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1.99
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2.1
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1.89
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100
0
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0
0
51
1.00
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56
0
0
43
0.99
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5.9
7
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0
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31
26
0
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2
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1.20
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0
0
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0.92
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36
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1.50
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1.9
16
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0
53
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6
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41
1.78
75839221--75839270
21
2.4
21
86
0
64
42
20
16
22
1.89
75848137--75848177
21
2.0
21
85
9
57
60
7
4
26
1.43
75848141--75848184
21
2.1
22
83
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63
6
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1.38
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29
2.2
29
100
0
128
23
14
20
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75852328--75852426
29
3.5
28
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1
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23
14
18
44
1.86
75855189--75855227
19
2.1
19
85
9
53
56
5
12
25
1.57
75858029--75858113
28
3.0
28
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192
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30
1.98
75867332--75867360
2
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2
100
0
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0
0
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17
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0
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37
2.8
37
78
11
104
32
8
4
53
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325