Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  289  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88993927--88994173
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3
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21
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20
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1.96
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175
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535
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21
21
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18
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0
1
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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25
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28
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2
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2
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14
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2
0
29
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
68
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26
0
57
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89099603--89099653
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2.2
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19
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0
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0
0
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1.11
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24
2.1
25
89
10
79
33
0
5
60
1.21
89111722--89111792
24
2.9
25
80
12
76
29
7
4
59
1.43
89116281--89116314
6
5.5
6
86
6
50
14
2
0
82
0.79
89119999--89120042
4
11.0
4
80
9
54
54
0
0
45
0.99
89119997--89120081
11
7.3
12
70
11
52
58
1
0
40
1.05
89120051--89120122
35
1.9
38
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15
89
56
2
1
38
1.22
89121608--89121638
16
1.9
16
93
0
53
74
3
0
22
0.96
89126136--89126173
19
2.1
19
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9
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47
5
2
44
1.39
89126351--89126379
11
2.6
11
100
0
58
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6
20
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1.80
89140522--89140620
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46
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1
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19
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28
1.98
89140834--89140947
44
2.6
44
91
0
174
29
21
23
24
1.99
89141037--89141193
44
3.6
45
77
3
122
33
20
22
24
1.97
89146427--89146478
14
3.8
14
82
7
54
63
9
1
25
1.35
89146566--89146612
3
15.7
3
100
0
94
68
0
0
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89146717--89147115
3
132.0
3
70
13
187
59
2
8
29
1.41
89147797--89147830
16
2.2
15
89
5
50
82
0
8
8
0.85
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127
2.5
126
83
5
401
36
21
17
25
1.95
89161501--89161536
18
2.0
18
100
0
72
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33
0
5
1.19
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19
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19
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4
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1.42
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12
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0
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22
5
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1.73
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180
2.0
180
92
1
603
31
10
17
39
1.84
89179196--89179230
2
17.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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15
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0
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22
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32
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2.3
11
100
0
50
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0
28
28
1.55
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0
0
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0
0
50
1.00
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2.1
19
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33
1.81
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26
4.2
26
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0
184
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30
1.9
31
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32
1.28
89192448--89192486
18
2.1
19
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61
5
0
33
1.18
89197189--89197227
20
2.0
20
94
0
69
66
2
17
12
1.35
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1
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1
100
0
54
0
0
0
100
0.00
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16.3
42
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422
41
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17
25
1.89
89203017--89203594
84
6.9
84
80
5
548
41
15
16
26
1.88
89203017--89203598
126
4.7
126
81
4
561
41
15
16
25
1.88
89203017--89203598
42
14.0
42
80
3
485
41
15
16
25
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89204830--89204883
23
2.2
24
80
9
65
57
5
5
31
1.45
89204864--89204931
28
2.4
28
77
13
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52
5
2
38
1.41
89204975--89205004
2
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2
100
0
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0
0
50
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23
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6
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89205155--89205183
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0
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0
0
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0
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1.96
89207343--89207535
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2.1
14
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0
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6
10
16
1.41
89207387--89207899
174
3.0
174
85
7
665
36
19
16
27
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325