Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  27  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6257502--6257543
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2.0
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23
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0
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22
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0
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320
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3
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1.35
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22
3.2
23
77
15
78
43
4
1
51
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.11
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20
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0
0
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0
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2.9
24
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24
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4.4
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25
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2.1
19
90
4
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5
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2.1
27
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2.9
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207
2.8
198
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17
18
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2.4
27
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3
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49
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18
2.6
16
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11
50
40
4
0
54
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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104
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16
0
53
1.44
6347101--6347186
5
15.8
5
77
11
73
30
15
0
54
1.41
6347101--6347212
22
4.9
22
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106
29
15
0
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1.40
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23
11
0
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1.27
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22
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12
0
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2.0
37
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5.0
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4.0
11
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20
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1.71
6358980--6359021
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2.0
22
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21
47
2
28
1.63
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2.4
16
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0
0
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11
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54
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2.0
194
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1
561
28
19
11
40
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6389990--6390068
26
3.0
26
78
10
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69
2
20
7
1.25
6389990--6390061
25
2.8
26
77
8
67
68
2
20
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1.29
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100
0
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0
0
50
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0
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0
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0
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0
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6413943--6413989
3
15.7
3
100
0
94
65
0
0
34
0.93
6416883--6416917
3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
6417194--6417233
22
1.9
21
85
10
55
62
2
7
27
1.35
6417469--6417504
18
1.9
19
88
5
56
58
0
2
38
1.13
6417470--6417527
18
3.3
17
79
13
55
67
0
1
31
1.01
6417782--6417857
9
8.1
9
71
8
53
28
3
1
65
1.18
6417765--6417830
28
2.3
29
79
7
82
34
1
3
60
1.21
6417782--6417831
19
2.7
19
81
3
66
28
2
2
68
1.12
6417863--6417917
20
2.8
20
79
20
78
41
5
0
52
1.24
6417871--6417910
19
2.1
19
90
9
64
42
7
0
50
1.30
6420051--6420144
46
2.0
46
97
0
179
18
29
17
35
1.93
6421759--6421792
16
2.1
16
89
10
52
32
0
8
58
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6426307--6426369
31
2.0
31
87
6
92
47
14
9
28
1.75
6428830--6428856
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
6434794--6434878
42
2.0
42
100
0
170
30
23
22
23
1.99
6453575--6453634
30
2.0
30
86
0
84
21
33
26
18
1.96
6467142--6467210
2
34.5
2
82
0
75
1
50
2
44
1.25
6467153--6467232
20
3.5
23
78
16
69
1
55
2
41
1.21
6467442--6467521
30
2.7
30
80
5
90
52
5
0
42
1.23
6484078--6484205
55
2.3
55
98
0
247
25
25
32
16
1.96
6484078--6484243
55
3.0
55
90
0
197
26
25
29
18
1.98
6484288--6484314
13
2.1
13
100
0
54
25
29
29
14
1.95
6488088--6488125
20
2.0
19
85
10
51
52
18
26
2
1.58
6497941--6497974
18
1.9
17
94
5
59
8
17
8
64
1.47
6499179--6499221
20
2.2
20
100
0
86
37
11
18
32
1.87
6499186--6499229
20
2.2
20
91
0
70
34
11
22
31
1.90
6499275--6499349
23
3.1
25
84
7
102
33
20
18
28
1.96
6499275--6499369
24
4.0
25
77
16
103
30
21
21
27
1.98
6499563--6499626
31
2.1
31
87
0
92
37
15
21
25
1.93
6508971--6509081
53
2.1
53
80
6
118
50
14
20
14
1.77
6510534--6510776
125
1.9
125
94
0
423
30
16
27
25
1.96
6511020--6511114
43
2.2
45
82
3
113
30
14
26
28
1.95
6510659--6511284
173
3.6
169
82
8
700
31
16
24
28
1.96
6530286--6530354
21
3.3
21
72
8
77
15
18
18
46
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6530279--6530440
42
3.9
42
89
6
231
17
21
17
43
1.88
6530307--6530375
21
3.3
21
72
8
77
15
20
18
44
1.86
6530367--6530438
21
3.4
20
71
9
54
20
20
13
44
1.86
6534339--6534386
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
6534429--6534489
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
6534539--6534681
24
6.0
24
90
4
200
28
21
22
27
1.99
6534539--6534681
47
3.0
47
89
5
198
28
21
22
27
1.99
6534539--6534682
71
2.0
72
87
4
211
29
21
22
27
1.99
6534873--6534936
31
2.1
31
93
0
110
39
14
21
25
1.91
6539014--6539189
50
3.5
49
85
6
228
30
26
17
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325