Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  57  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Period
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Copy
Number
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Score
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1.28
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60.7
3
73
14
119
63
2
5
28
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15144547--15144629
3
28.3
3
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11
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61
3
3
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1.30
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0
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15152595--15152651
29
2.0
29
89
0
87
36
19
14
29
1.91
15152616--15152838
29
7.5
28
69
12
117
42
17
13
27
1.85
15152692--15152790
30
3.3
30
73
8
103
48
11
13
27
1.75
15152616--15152814
59
3.3
59
79
4
229
44
16
12
27
1.83
15155219--15155362
43
3.3
43
77
7
114
29
13
21
35
1.91
15158914--15158973
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
15159707--15159795
27
3.3
27
84
1
117
28
22
14
34
1.93
15166112--15166206
47
2.0
47
95
0
172
44
29
11
14
1.81
15166498--15166548
27
2.0
26
84
7
68
33
21
27
17
1.96
15167196--15167263
27
2.6
27
80
2
84
26
26
14
32
1.95
15168108--15168185
41
1.9
41
91
0
129
39
12
15
32
1.85
15174708--15174918
113
1.9
113
94
0
377
33
18
11
36
1.87
15175135--15175194
6
10.0
6
88
0
75
11
0
21
66
1.23
15175139--15175194
12
4.7
12
88
0
85
10
0
21
67
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15175157--15175191
3
11.7
3
93
0
61
2
0
28
68
1.04
15184538--15184832
147
2.0
147
97
0
563
12
25
26
35
1.92
15201136--15201182
25
1.9
24
82
4
58
36
2
4
57
1.30
15203510--15203613
50
2.1
50
100
0
208
19
5
33
41
1.75
15204024--15204055
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
15208453--15208505
13
3.8
14
76
16
56
52
0
0
47
1.00
15208453--15208513
14
4.7
12
79
16
52
49
0
0
50
1.00
15209282--15209308
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
15223116--15223152
20
1.9
20
88
5
58
40
0
8
51
1.32
15225310--15225628
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7.0
46
89
1
417
38
15
24
21
1.92
15225310--15225651
137
2.5
138
85
2
440
39
15
23
21
1.92
15227459--15227553
44
2.2
44
84
3
122
34
21
16
27
1.95
15227506--15227621
44
2.7
41
77
6
115
32
22
18
26
1.97
15237493--15237701
28
7.5
28
74
5
111
29
19
19
31
1.97
15237512--15237701
56
3.4
56
82
0
209
29
20
18
32
1.96
15237510--15237668
84
1.9
84
88
0
237
29
20
18
30
1.97
15237510--15237696
84
2.2
84
82
0
221
30
20
17
31
1.96
15241064--15241261
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
15241130--15241247
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
15241098--15241261
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
15248632--15248829
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
15248698--15248815
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15248666--15248829
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
15250626--15250701
39
1.9
39
100
0
152
39
26
6
27
1.81
15251952--15251986
18
1.9
18
94
0
61
45
11
14
28
1.79
15260330--15260398
36
1.9
36
84
0
93
27
15
27
28
1.96
15261700--15261833
67
2.0
67
100
0
268
49
17
11
20
1.79
15268455--15268862
45
8.8
45
72
10
252
32
15
21
31
1.94
15268452--15268717
141
1.9
132
83
6
334
31
14
21
31
1.94
15268543--15268758
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2.3
96
86
1
310
32
15
20
31
1.93
15268784--15268875
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2.1
44
85
0
121
33
18
19
28
1.95
15270622--15270652
15
2.0
15
93
6
53
25
6
0
67
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325