Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  325  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98487085--98487150
10
6.2
10
81
13
62
59
3
0
37
1.13
98495152--98495208
24
2.4
24
93
0
96
33
14
7
45
1.71
98512423--98512475
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
37
1.92
98513956--98514065
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
98515852--98515980
50
2.5
51
87
5
181
37
16
20
24
1.93
98515958--98516135
31
5.7
31
89
2
268
26
20
26
26
1.99
98516159--98516282
47
2.7
47
88
3
171
27
16
26
29
1.97
98516254--98516350
42
2.3
42
89
3
142
30
14
26
27
1.95
98516274--98516368
42
2.3
42
81
5
111
32
14
24
28
1.95
98521345--98521427
21
4.0
21
73
9
71
34
25
24
15
1.95
98521346--98521426
43
1.9
43
82
9
105
33
25
24
16
1.96
98521618--98521715
28
3.8
23
80
13
79
46
32
5
15
1.67
98521633--98521715
28
2.9
28
90
1
130
46
31
3
18
1.66
98526950--98527285
30
11.3
31
78
10
226
40
12
23
23
1.89
98526950--98527288
89
3.8
88
77
9
276
39
12
23
23
1.89
98526975--98527285
119
2.6
118
82
2
390
40
12
23
23
1.88
98530547--98530590
18
2.3
20
77
22
58
54
11
6
27
1.61
98542268--98542453
40
4.7
40
89
4
243
26
25
21
26
2.00
98545147--98545187
21
2.0
21
85
0
55
31
21
24
21
1.98
98546269--98546300
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
98547089--98547163
39
1.9
39
97
0
141
36
24
28
12
1.91
98547133--98547192
29
2.1
29
96
0
111
35
23
31
10
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98549403--98549457
27
2.0
27
100
0
110
47
10
3
38
1.56
98562803--98562834
14
2.2
15
94
5
57
81
0
0
18
0.70
98569239--98569337
50
2.0
50
95
0
180
21
12
25
41
1.87
98577095--98577134
21
2.0
20
85
5
53
65
5
0
30
1.14
98578645--98578674
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
98579269--98579346
3
27.0
3
71
7
54
64
0
29
6
1.18
98579269--98579317
20
2.5
20
89
0
71
65
0
28
6
1.16
98579269--98579351
29
2.8
29
80
9
78
65
0
28
6
1.17
98580485--98580525
21
2.0
21
95
0
73
29
29
17
24
1.97
98580915--98580952
19
2.0
19
89
0
58
55
31
5
7
1.51
98584372--98584416
22
2.0
22
95
0
81
57
24
8
8
1.57
98589166--98589194
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325

The End!