Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  13  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2925277--2925315
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2.3
17
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0
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2
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2.1
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0
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0
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2
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30
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2.0
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241
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2979352--2979513
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2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2979185--2979835
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165
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4
880
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1.96
2979507--2979678
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2.3
76
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4
222
32
20
18
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1.96
2979658--2979692
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2.5
127
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1.95
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2.7
70
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25
1.91
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37
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4
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27
0
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31.0
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2
60
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2.1
24
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4
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1.32
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33
5
2
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1.35
3002260--3002310
21
2.2
24
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10
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33
1
0
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1.05
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3
54.3
3
70
13
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3
60
1.38
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25
2.2
25
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32
3
3
60
1.32
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0
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17
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36
15
0
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1.45
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8.0
45
87
3
471
20
23
15
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
50
0
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40
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1.40
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7.7
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51
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0
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18
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53
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0
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0
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90
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70
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0
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0
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13
29
20
1.91
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3.8
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10
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28
28
21
21
1.98
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1.8
93
91
0
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28
28
22
21
1.99
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1.9
17
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2.1
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0
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26
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205
32
6
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36
1.82
3044394--3044523
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2.6
50
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4
210
32
6
23
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1.82
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20
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0
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1.97
3048685--3048915
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31
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1.25
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2.8
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190
35
3
15
45
1.64
3054936--3055108
30
5.5
30
74
20
165
35
2
15
46
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3054920--3055129
64
3.3
64
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2
372
35
2
15
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1.58
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110
3.5
112
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455
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2
15
46
1.60
3055046--3055176
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2.8
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94
3
217
35
3
14
46
1.60
3055110--3055218
30
3.5
30
72
18
114
36
3
13
45
1.62
3054852--3055236
174
2.2
174
96
0
698
35
2
15
47
1.60
3055094--3055236
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2.3
63
91
3
234
34
2
14
47
1.59
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25
2.6
25
82
0
83
29
12
42
15
1.84
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2.5
21
96
0
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0
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1.25
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2.0
26
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22
15
24
1.92
3062494--3062733
83
2.9
83
84
4
299
24
17
20
37
1.94
3062473--3062775
41
7.4
41
76
7
258
25
17
20
36
1.94
3063380--3063483
21
5.0
21
75
4
75
45
17
21
16
1.86
3067479--3067512
17
2.0
17
94
0
59
32
11
32
23
1.91
3067683--3067743
30
2.1
28
90
6
95
24
3
14
57
1.53
3067867--3067899
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
3071133--3071283
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
3078648--3078798
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
3090308--3090342
18
2.0
17
94
5
61
57
0
0
42
0.99
3090986--3091019
17
2.0
17
88
0
50
52
0
0
47
1.00
3099430--3099488
29
2.0
29
96
0
109
38
1
16
42
1.59
3100336--3100408
23
3.3
23
66
24
66
36
4
15
43
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3100354--3100421
21
3.2
21
67
24
61
38
5
17
38
1.74
3100329--3100425
43
2.3
42
92
3
167
40
4
16
39
1.68
3102651--3102684
16
2.2
15
89
5
50
23
2
8
64
1.36
3110159--3110307
75
2.0
75
85
2
201
25
17
12
44
1.84
3116234--3116275
22
2.0
21
85
4
57
61
14
0
23
1.32
3125563--3125635
31
2.4
31
85
0
101
46
10
8
34
1.69
3126246--3126289
22
2.0
22
86
0
61
52
0
0
47
1.00
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16
2.3
16
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13
58
59
0
0
40
0.97
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13
7.6
14
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24
50
46
1
0
50
1.18
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15
4.2
15
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16
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48
0
1
50
1.10
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3
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100
0
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0
0
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2
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0
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0
0
50
1.00
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1.9
18
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0
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8
45
1.65
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3
13.7
3
100
0
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31
0
0
68
0.90
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16
26
1.97
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136
2.1
137
95
0
511
32
24
18
24
1.97
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26
2.1
27
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67
24
14
24
37
1.93
3135757--3135864
26
4.2
26
95
2
175
37
24
4
34
1.76
3135860--3135884
10
2.5
10
100
0
50
32
12
8
48
1.69
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3
12.7
3
100
0
76
34
0
0
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23
4.2
23
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19
51
35
3
5
56
1.37
3136599--3136642
19
2.4
19
88
7
65
36
0
2
61
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3136599--3136642
18
2.4
18
88
7
63
36
0
2
61
1.09
3136738--3136781
15
3.1
14
84
12
54
34
0
6
59
1.24
3136735--3136775
17
2.4
17
79
0
55
34
0
9
56
1.32
3137123--3137158
3
12.0
3
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0
54
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5
0
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1.19
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26
2.2
26
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58
1
5
34
1.30
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26
2.6
25
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9
71
56
0
9
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1.31
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26
4.8
26
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6
119
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5
3
29
1.34
3138712--3138777
27
2.5
26
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80
68
7
1
22
1.24
3138687--3138834
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140
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4
4
29
1.35
3142835--3142942
26
4.2
26
95
0
189
37
24
6
31
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325