Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  311  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.93
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1.94
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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1
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1.21
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15
3.3
15
80
11
55
27
8
0
64
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94687514--94687574
31
2.0
29
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6
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26
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22
0
33
43
1.54
94694050--94694111
29
2.1
29
82
5
72
25
1
33
38
1.66
94694324--94694355
16
2.0
16
100
0
64
37
6
6
50
1.53
94697493--94697794
64
4.7
64
96
0
534
37
9
4
48
1.57
94697594--94697681
21
4.1
21
63
13
54
37
10
4
47
1.58
94698668--94698735
24
2.8
24
88
0
100
27
17
7
47
1.74
94698912--94698967
15
3.8
15
80
20
73
46
0
0
53
1.00
94699072--94699297
9
24.6
9
76
8
143
47
12
0
38
1.48
94699072--94699297
18
12.3
18
75
9
161
47
12
0
38
1.48
94699100--94699321
114
1.9
114
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313
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12
0
38
1.48
94705378--94705752
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43
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25
33
18
22
1.97
94705378--94705752
88
4.3
86
94
1
644
25
33
18
22
1.97
94706637--94706667
2
15.5
2
100
0
62
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0
0
48
1.00
94707857--94707926
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2.4
30
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13
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34
12
4
48
1.61
94711671--94711703
3
11.0
3
100
0
66
33
0
33
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94717497--94717685
38
4.9
38
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6
202
21
23
25
29
1.99
94717506--94717685
76
2.3
78
84
4
231
22
22
25
29
1.99
94729941--94730001
21
3.0
21
72
13
65
55
1
0
42
1.09
94730235--94730267
15
2.1
16
94
5
59
69
9
0
21
1.15
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2.5
20
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15
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20
16
18
44
1.86
94734927--94735385
228
2.0
228
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2
618
33
22
10
34
1.88
94741716--94741759
17
2.7
15
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47
2
0
50
1.13
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0
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1.36
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0
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2.5
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20
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48
1
1
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1.22
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27
2.1
27
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1
0
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1.10
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15
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15
100
0
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13
13
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1.78
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10
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35
45
4
14
1.66
94751119--94751185
33
2.0
33
100
0
134
22
14
14
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1.81
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50
2.6
51
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2
199
34
17
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25
1.96
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31
5.8
31
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0
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26
26
1.98
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42
3.0
43
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8
115
31
14
25
29
1.95
94752895--94753067
47
3.6
48
83
9
185
28
15
25
30
1.96
94754302--94754334
12
2.8
12
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0
57
78
0
9
12
0.95
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19
1.9
18
88
11
54
82
0
2
14
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1.9
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80
0
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0.91
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3
15.0
3
90
0
63
28
2
4
64
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94755633--94755705
38
1.9
38
83
5
94
39
1
4
54
1.28
94759049--94759086
20
2.0
20
84
5
51
52
10
0
36
1.36
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80
2.0
80
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0
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27
2.1
27
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27
5
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1.52
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2.0
29
84
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42
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39
1.68
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1.9
163
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1
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15
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2.1
17
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0
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48
2.0
48
87
0
136
52
3
21
23
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325