Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  268  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Score
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2.1
22
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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Score
A
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(0-2)
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21
95
57
2
4
35
1.33
83405883--83405964
16
4.9
16
68
22
53
59
2
2
35
1.24
83405872--83405952
38
2.1
38
84
13
103
60
2
2
34
1.23
83405870--83405989
11
10.2
12
71
21
85
58
2
1
37
1.22
83413791--83413833
18
2.4
18
92
0
68
44
6
25
23
1.78
83414416--83414446
7
4.4
7
95
0
53
58
12
3
25
1.50
83415343--83415414
10
7.0
11
73
9
55
66
1
0
31
1.00
83415355--83415418
31
2.1
31
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5
103
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1
0
29
0.99
83417442--83417467
13
2.0
13
100
0
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0
15
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0.99
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33
0
3
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1.12
83420627--83420695
15
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16
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16
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34
1
4
59
1.26
83421150--83421205
17
3.2
18
78
14
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35
1
0
62
1.06
83421139--83421211
17
4.6
16
75
9
60
38
1
0
60
1.06
83421148--83421211
31
2.1
31
83
13
80
39
1
0
59
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83425217--83425326
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4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
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136
2.1
136
96
0
525
24
18
24
31
1.98
83428608--83428644
17
2.2
17
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4
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62
10
2
24
1.41
83428651--83428692
2
21.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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6.9
13
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0
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27
7
30
34
1.85
83429140--83429214
26
2.9
26
100
0
150
28
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30
1.86
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44
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1
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11
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0
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30
2.1
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39
20
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145
2.0
146
92
2
475
33
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1.9
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0
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0
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15
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39
1.72
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2.0
41
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46
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14
200
21
20
29
28
1.98
83463770--83463941
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1.8
93
93
2
301
21
20
29
27
1.98
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0
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0
15
0
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5
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56
56
2
0
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2.0
20
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23
2.1
24
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7
59
3
23
0
72
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83481103--83481134
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2.1
16
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53
0
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1.26
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2.0
23
100
0
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25
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29
2.0
28
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3
5
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29
2.1
29
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66
5
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26
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2.0
216
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0
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0
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3.0
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80
0
4
14
0.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325