Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  47  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Indels
Score
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121
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0
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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101
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18
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1.91
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15
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2.0
101
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0
375
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21
13
22
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12027197--12027291
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3.2
30
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4
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10
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38
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0
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0.75
12035663--12035702
14
2.9
14
84
0
53
40
5
15
40
1.68
12036098--12036218
62
2.0
62
91
0
197
37
11
13
38
1.81
12036619--12036681
26
2.4
26
81
5
74
57
1
0
41
1.08
12036613--12036686
8
8.7
9
72
19
61
52
1
0
45
1.09
12036613--12036686
17
4.4
17
77
11
80
52
1
0
45
1.09
12036848--12036891
20
2.2
20
84
8
54
43
2
0
54
1.12
12036845--12036903
25
2.3
26
77
11
68
45
1
0
52
1.10
12046258--12046311
25
2.2
25
96
0
99
35
9
12
42
1.75
12050914--12050962
25
2.0
25
95
0
89
34
6
18
40
1.75
12053688--12053726
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16
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8
53
69
0
0
30
0.89
12056810--12056928
48
2.4
48
83
4
132
40
10
5
43
1.62
12062877--12062902
5
5.2
5
100
0
52
80
0
0
19
0.71
12064173--12064290
42
2.8
43
73
10
116
25
21
26
27
1.99
12067308--12067535
47
4.8
47
80
6
214
32
26
14
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12068069--12068099
16
1.9
16
100
0
62
51
9
0
38
1.35
12071642--12071699
30
1.9
31
89
3
91
51
1
18
27
1.56
12071954--12071978
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
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2
51.5
2
100
0
206
50
49
0
0
1.00
12079228--12079271
12
3.6
12
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3
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0
25
0
75
0.81
12079228--12079277
25
2.0
24
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3
64
4
22
0
74
0.99
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2.3
53
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12
135
35
0
6
58
1.24
12083420--12083456
5
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5
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0
2
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6
7.0
6
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0
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16
14
16
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1.75
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2.0
110
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0
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27
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1.80
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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3
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11
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4
3
29
1.31
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17
2.2
16
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5
54
80
0
19
0
0.71
12095191--12095249
23
2.6
23
80
0
73
30
11
15
42
1.83
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3
219
23
22
22
31
1.98
12095806--12095920
36
3.2
36
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3
106
23
22
20
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1.98
12097320--12097431
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2.4
46
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2
163
31
30
18
19
1.96
12098876--12098935
21
2.9
20
75
5
57
33
33
11
21
1.90
12099877--12099970
46
2.0
46
97
0
179
40
5
8
45
1.57
12108081--12108153
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
12109311--12109357
19
2.6
18
75
18
51
4
17
2
76
1.04
12115975--12116047
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12117218--12117273
24
2.3
24
84
9
69
7
16
1
75
1.11
12119650--12119828
33
5.4
33
71
8
112
31
15
24
28
1.95
12119628--12119876
101
2.5
102
86
5
339
31
15
24
28
1.95
12129492--12129544
20
2.7
19
78
18
56
33
28
0
37
1.58
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9
2.8
9
100
0
50
28
0
0
72
0.86
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9.3
47
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1
677
28
30
8
32
1.87
12134828--12134906
25
3.3
25
66
16
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31
30
5
32
1.79
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1.9
237
93
0
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28
30
8
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1.87
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2.1
19
90
0
62
45
17
25
12
1.83
12148103--12148161
31
2.0
29
83
6
73
27
1
10
61
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325