Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  53  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13741763--13742048
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21
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1.8
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32
19
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2.3
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28
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18
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30
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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64
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32
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0.99
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1.9
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100
0
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2
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141
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358
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18
29
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13953634--13953765
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2.8
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44
19
17
1.87
13996511--13996576
28
2.5
26
82
7
89
18
42
19
19
1.90
14000268--14000312
13
3.4
13
81
6
54
53
0
2
44
1.13
14001262--14001287
7
3.7
7
100
0
52
30
0
0
69
0.89
14005044--14005226
100
1.8
99
79
1
213
38
13
12
36
1.82
14005112--14005529
225
1.9
226
85
2
581
38
14
13
34
1.84
14005492--14005563
22
3.4
22
71
11
78
45
11
5
37
1.63
14005488--14005570
41
2.0
41
97
0
157
44
13
6
36
1.68
14009692--14009819
62
2.0
64
85
8
172
53
11
14
20
1.72
14011478--14011581
45
2.3
45
83
0
118
31
19
10
38
1.86
14012372--14012418
2
23.5
2
100
0
94
48
0
0
51
1.00
14018645--14018729
10
8.8
10
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14
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0
3
31
1.10
14018635--14018722
19
4.8
18
75
15
83
67
0
2
30
1.03
14018629--14018722
9
10.4
8
71
21
62
67
0
3
29
1.07
14018643--14018732
47
1.9
47
84
8
121
64
0
4
31
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14018696--14018750
10
5.6
10
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12
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65
0
7
27
1.19
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92
2.4
91
78
7
254
23
21
27
28
1.99
14027544--14027762
46
4.8
46
77
10
214
22
21
26
28
1.99
14030515--14030553
18
2.2
18
85
0
51
30
7
15
46
1.74
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21
3.7
19
73
15
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36
0
2
61
1.11
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22
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26
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18
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0
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0
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1.76
14037212--14037319
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2.1
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32
1.76
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2.0
22
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0
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4
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20
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1.13
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2.0
28
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22
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4
5
23
1.31
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3
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230
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3
0
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20.0
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0
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0
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1.00
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4
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0
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1.50
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100
0
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1.59
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2
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2
100
0
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0
0
51
1.00
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5.0
46
97
0
388
22
23
14
39
1.91
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2.4
16
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0
60
0
30
0
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2
19.0
2
94
5
67
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14071616--14071866
94
2.7
92
82
3
256
27
24
13
34
1.93
14073124--14073219
33
3.1
33
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96
25
25
22
27
2.00
14073364--14073428
27
2.4
27
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20
21
18
1.92
14073618--14073683
27
2.4
27
92
0
105
24
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18
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126
4.5
126
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0
957
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0
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4.4
17
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19
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20
2
0
77
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325