Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  291  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89435908--89435998
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2.0
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89605241--89605303
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0
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55
1.20
89607773--89607828
24
2.3
24
100
0
112
26
19
26
26
1.99
89611565--89611642
22
3.5
23
78
16
92
53
1
0
44
1.08
89611690--89611806
20
5.7
20
75
17
91
58
0
0
41
1.04
89611723--89611794
36
1.9
38
88
5
112
61
0
0
38
0.96
89611751--89611806
22
2.4
23
82
17
71
57
1
0
41
1.09
89611882--89611942
24
2.6
23
82
5
70
73
6
3
16
1.17
89611883--89611926
24
1.9
23
90
9
72
72
4
2
20
1.13
89612534--89612578
17
2.5
20
79
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60
4
0
35
1.17
89623958--89624080
56
2.2
57
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2
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39
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1.68
89624830--89624854
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0
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0
0
48
1.00
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23
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4
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33
2
6
57
1.37
89632248--89632315
31
2.2
31
86
5
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47
8
13
30
1.73
89638976--89639067
35
2.6
35
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0
130
30
9
26
33
1.88
89644463--89644511
23
2.1
23
96
0
89
53
4
14
28
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89652468--89652527
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2.3
27
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8
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31
13
11
43
1.80
89652468--89652527
26
2.3
26
85
5
77
31
13
11
43
1.80
89665475--89665504
15
1.9
16
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6
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46
0
0
53
1.00
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27
5.2
28
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5
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24
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1.96
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28
2.8
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12
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1.90
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26
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0
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1.80
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28
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24
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1.96
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1.94
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5.2
26
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1.81
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2
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33
27
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24
1.94
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19
2.1
19
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0
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0
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0
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1.53
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2
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0
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0
0
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0
0
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1.80
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2.2
24
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0
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51
7
3
36
1.49
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29
3.0
29
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0
149
35
36
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19
1.83
89698621--89698676
30
1.9
28
85
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76
51
3
14
30
1.59
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1.9
47
95
0
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13
13
31
1.82
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12
2.3
12
100
0
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17
21
1.89
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16
1.9
15
93
6
51
16
0
0
83
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89705355--89705419
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2.0
32
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0
130
30
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2.0
26
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7
72
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15
24
1.92
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131
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132
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0
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0
0
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0
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133
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1.98
89712360--89713066
265
2.7
266
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1
1123
28
24
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132
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460
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2
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0
51
53
0
0
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2.0
15
93
0
51
30
0
3
66
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325