Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  226  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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18
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40
4.2
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25
22
27
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1.99
70441563--70441713
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20
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24
28
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.3
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1.51
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19
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2.5
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0
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77
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2.5
28
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0
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35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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93
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21
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28
1.99
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3.6
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118
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1.96
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22
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0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70562550--70562580
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2.1
15
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0
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6
0
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1.18
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3
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11
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4
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1.27
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0
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0
0
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2.2
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90
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21
23
35
1.96
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33
2.6
34
74
5
86
29
12
30
27
1.93
70597165--70597234
31
2.3
31
94
0
122
57
0
22
20
1.41
70601917--70602072
29
5.4
29
81
0
132
39
20
14
25
1.91
70605770--70605985
46
4.7
46
91
0
315
39
15
23
21
1.91
70605720--70605985
138
2.0
130
87
5
379
39
15
23
21
1.92
70608880--70608926
20
2.3
21
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10
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42
17
12
27
1.85
70608691--70609096
114
3.5
114
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4
435
38
17
13
30
1.88
70614257--70614294
18
2.1
18
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9
51
23
34
0
42
1.55
70614278--70614331
26
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26
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0
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1.57
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29
2
0
67
1.05
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2.0
40
97
0
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24
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77
2.5
76
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9
238
44
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10
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1.78
70623300--70623498
78
2.6
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8
240
44
14
10
31
1.78
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2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
15
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0
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39
0
12
48
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40
5.5
40
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3
316
24
23
27
24
2.00
70636707--70636927
119
1.9
119
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5
331
25
22
27
24
2.00
70643976--70644192
40
5.5
40
87
6
291
25
22
27
24
2.00
70643971--70644192
119
1.9
119
85
5
315
26
22
27
24
2.00
70647769--70647938
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1.8
93
93
0
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29
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1.98
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46
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1.98
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2.0
30
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1
0
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0.93
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0
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0
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26
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2.00
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2.0
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0
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2.1
22
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1.56
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2.5
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28
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27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
70703776--70703857
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
70708338--70708368
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0
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0
0
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2
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2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70710693--70710720
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2
100
0
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0
0
50
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30
1.97
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0
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26
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1.9
93
92
2
294
27
29
21
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325