Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  294  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90179756--90179798
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20
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24
10
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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22
0
68
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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105
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1.94
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11
53
47
25
1
25
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90350905--90350978
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3.5
21
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1.63
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39
0
5
54
1.23
90354438--90354498
11
5.0
11
78
18
59
40
0
1
57
1.08
90354413--90354546
39
3.4
39
94
0
232
41
0
4
54
1.21
90354413--90354550
20
7.1
20
68
12
81
40
0
4
55
1.20
90354521--90354578
30
2.0
29
89
3
89
50
0
0
50
1.00
90354415--90354575
78
2.1
78
85
2
216
44
0
3
52
1.19
90356381--90356409
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
90356822--90356884
21
3.0
21
88
4
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30
20
47
1
1.60
90357126--90357191
31
2.1
31
91
0
105
16
10
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50
1.76
90357256--90357550
43
6.8
43
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5
229
27
33
20
18
1.96
90357267--90357550
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3.3
86
86
1
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26
33
20
19
1.96
90357267--90357550
129
2.2
129
84
1
363
26
33
20
19
1.96
90357733--90357773
18
2.4
17
91
4
64
39
14
9
36
1.79
90359314--90359350
18
2.1
18
94
0
65
29
2
5
62
1.31
90371297--90371387
44
2.1
44
91
0
146
50
9
9
29
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90374450--90374499
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2.8
18
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17
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34
4
4
58
1.36
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25
2.0
25
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0
82
34
18
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26
1.96
90377779--90377887
54
2.0
54
98
0
209
37
22
15
24
1.93
90382628--90382652
6
4.2
6
100
0
50
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0
0
16
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2.0
60
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50
4
5
40
1.43
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64
2.0
64
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0
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15
18
40
1.90
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51
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26
15
26
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1.96
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3.1
52
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1.95
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0
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1
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2.1
18
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0
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1.88
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153
25
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1.98
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2.6
45
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7
145
24
30
20
25
1.98
90406122--90406292
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3.7
46
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12
145
22
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28
1.99
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2.2
17
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1.41
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29
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17
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1.69
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55
2.0
55
100
0
220
41
18
5
34
1.73
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26
3.2
26
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15
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44
19
5
30
1.74
90415710--90415778
11
6.6
10
73
12
50
59
1
1
37
1.15
90415796--90415843
21
2.2
21
82
14
53
39
0
6
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1.26
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369
2.0
370
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0
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33
14
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28
1.94
90421441--90421478
19
2.0
19
94
0
67
36
7
10
44
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90421471--90421504
4
8.2
4
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6
50
73
0
2
23
0.97
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25
2.3
23
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64
0
33
1
1.04
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0
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0
0
22
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28
3.6
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125
26
17
32
23
1.97
90423890--90424015
56
2.2
56
90
0
189
27
18
30
23
1.97
90423917--90424015
28
3.5
28
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0
126
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1.97
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2.3
32
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0
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1.85
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15
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0
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10
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14
2.1
14
100
0
58
48
20
0
31
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325