Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  15  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3442582--3442688
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2.5
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86
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262
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2.1
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2.1
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0
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15
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0
50
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0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3467771--3467890
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4
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17
3.9
17
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3
0
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1.11
3481878--3481926
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1.9
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0
2
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0
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137
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72
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0
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22
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13
62
42
0
2
54
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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4
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1.30
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0
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1.25
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10.3
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1
48
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0
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1.00
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19
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16
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21
21
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50
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3530588--3530619
13
2.6
13
90
9
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25
6
3
65
1.31
3530798--3530886
22
4.1
22
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67
22
6
4
66
1.34
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80.3
3
67
14
93
31
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2
57
1.42
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3.9
15
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89
35
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12
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100
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0
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0
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11
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2
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1
3
51
1.26
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18
2.2
18
86
9
53
35
0
0
64
0.94
3535750--3535814
22
3.0
21
79
16
71
56
1
0
41
1.08
3535812--3535863
18
2.9
18
80
5
61
69
1
1
26
1.10
3540483--3540536
15
3.5
15
74
18
56
59
0
5
35
1.21
3540487--3540542
17
3.4
17
78
9
71
60
0
5
33
1.19
3540481--3540551
32
2.2
32
97
0
133
60
0
4
35
1.16
3540574--3540607
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
3542321--3542364
2
22.5
2
95
4
81
47
0
0
52
1.00
3547186--3547218
9
3.7
9
95
0
57
30
0
0
69
0.88
3547853--3547934
32
2.6
32
98
0
155
37
13
18
30
1.89
3555114--3555271
51
3.1
51
96
0
280
31
15
24
29
1.95
3556423--3556479
30
1.9
30
85
7
80
42
5
24
28
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3559414--3559580
46
3.7
45
85
4
203
25
20
31
22
1.98
3559363--3559574
92
2.3
90
82
4
237
26
19
31
22
1.98
3559414--3559617
46
4.5
43
82
11
171
25
20
30
23
1.98
3559414--3559580
90
1.8
91
84
5
221
25
20
31
22
1.98
3566097--3566130
11
2.9
12
86
8
52
35
0
0
64
0.94
3566670--3566729
27
2.2
27
96
0
111
66
10
0
23
1.21
3566679--3566726
16
3.3
16
70
27
52
66
8
0
25
1.19
3567193--3567225
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
3568670--3568702
16
2.1
16
88
5
50
24
6
30
39
1.79
3569224--3569262
20
2.0
19
85
14
53
51
2
5
41
1.38
3574929--3574980
27
2.1
25
86
13
72
32
0
1
65
1.04
3576142--3576190
21
2.4
20
87
12
73
73
10
10
6
1.25
3576333--3576378
3
15.7
3
81
4
58
67
0
32
0
0.91
3576332--3576378
23
2.0
23
95
0
85
68
0
31
0
0.90
3576838--3576906
15
4.5
15
73
7
57
68
4
8
18
1.33
3577098--3577157
29
2.1
29
87
6
86
66
3
5
25
1.27
3576944--3577671
302
2.4
300
94
1
1253
58
6
7
27
1.49
3576944--3577671
150
4.8
151
95
1
1250
58
6
7
27
1.49
3577719--3577754
18
1.9
19
88
5
56
69
0
0
30
0.89
3577710--3577745
12
2.8
13
87
8
56
69
0
0
30
0.89
3579655--3579799
72
2.0
72
89
2
220
22
26
16
35
1.95
3580145--3580201
24
2.4
24
96
0
105
28
0
10
61
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3580358--3580395
17
2.2
17
90
9
60
47
10
10
31
1.72
3585251--3585399
31
4.8
31
91
3
246
26
18
28
26
1.98
3585468--3585639
49
3.7
47
85
8
205
29
14
26
29
1.95
3585511--3585674
42
3.7
43
83
9
172
30
14
26
28
1.95
3587743--3587805
26
2.5
25
85
12
85
44
9
7
38
1.66
3587926--3587957
15
2.1
15
100
0
64
0
37
0
62
0.95
3588094--3588138
18
2.4
19
88
3
65
8
11
6
73
1.25
3588092--3588139
19
2.5
19
86
10
71
10
10
6
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1.26
3592681--3592720
20
2.0
20
85
5
53
72
5
12
10
1.26
3597221--3597254
18
1.9
18
88
5
52
29
0
5
64
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325