Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  72  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19831201--19831257
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0
0
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306
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20
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1.98
19837131--19837358
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4.7
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20
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21
1.98
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26
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24
1.97
19844869--19845114
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2.6
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2.0
22
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23
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1.9
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23
23
28
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1.99
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0
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2.7
26
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2
0
32
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19857139--19857207
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2.7
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2
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2
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2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
19875367--19875459
43
2.2
43
92
3
152
27
6
13
51
1.66
19883924--19884021
43
2.3
43
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3
126
28
29
27
14
1.95
19885279--19885341
25
2.5
24
80
14
83
36
20
25
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19885486--19885557
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24
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15
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18
29
18
1.94
19890623--19890674
18
2.9
18
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0
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30
28
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30
1.89
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17
2.9
19
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5
7
1.01
19903027--19903064
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3.1
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85
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0
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0
0.74
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11
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21
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1
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1.27
19904462--19904591
61
2.1
61
86
0
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2
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2.2
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0
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21
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2.0
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8
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12
4.1
13
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12
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8
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1.61
19914699--19914751
27
2.0
27
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16
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1.91
19917376--19917704
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1.97
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1.9
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2
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16
29
25
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19917375--19917704
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2.3
143
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342
26
17
30
25
1.97
19919793--19920036
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4.9
49
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4
274
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18
25
29
1.98
19919794--19920036
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2.4
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83
3
288
27
18
25
29
1.98
19922222--19922284
30
2.1
31
90
3
101
28
1
47
22
1.60
19926166--19926422
127
2.0
127
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3
338
28
14
22
34
1.94
19928069--19928198
49
2.7
49
85
2
154
21
27
22
28
1.99
19928121--19928288
93
1.8
92
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232
23
27
21
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1.99
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2.0
22
100
0
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8
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0
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2.8
10
100
0
56
10
42
7
39
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19953261--19953307
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2.1
22
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1.66
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2.0
21
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29
1.97
19953838--19953920
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2.4
34
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2
14
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1.51
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313
19
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26
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1.81
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21
3.3
21
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34
34
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1.88
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2.1
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19997695--19997807
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2.0
56
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190
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16
20
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20001994--20002053
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2
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0
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0
4
48
1.23
20030550--20030675
55
2.3
55
83
2
155
26
30
21
20
1.98
20031459--20031754
47
6.3
46
75
12
244
23
29
18
29
1.98
20031485--20031757
95
2.9
92
79
10
295
23
29
18
28
1.98
20032103--20032160
30
1.9
30
92
0
98
27
25
15
31
1.96
20038018--20038152
55
2.5
55
83
2
173
27
29
20
22
1.98
20038916--20039231
49
6.7
46
77
9
271
22
28
20
28
1.98
20038962--20039232
95
2.9
92
78
7
296
23
29
19
28
1.98
20042096--20042144
24
2.0
24
92
0
80
57
16
16
10
1.65
20050123--20050264
40
3.5
40
82
3
117
28
22
26
22
1.99
20050162--20050290
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
20058139--20058305
40
4.2
40
78
6
160
26
22
26
25
2.00
20061852--20061989
49
2.8
49
89
0
213
29
28
17
24
1.97
20063482--20063538
27
2.2
26
81
9
62
21
5
3
70
1.22
20063806--20063841
17
2.1
17
89
0
54
25
8
0
66
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20067913--20067943
14
2.2
14
94
0
53
32
0
12
54
1.38
20076721--20076831
43
2.6
43
79
12
122
26
24
23
26
2.00
20083196--20083377
65
2.8
65
85
0
247
22
31
23
22
1.99
20089071--20089191
55
2.2
55
83
2
145
33
30
19
17
1.94
20092657--20092710
20
2.8
18
77
20
56
42
1
0
55
1.10
20094588--20094642
27
2.0
28
96
3
103
67
3
7
21
1.31
20095470--20095526
22
2.6
22
97
0
105
29
19
26
24
1.98
20095566--20095622
22
2.6
22
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5
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33
14
21
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1.92
20106241--20106268
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.4
26
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2
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41
22
17
19
1.90
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27
4.2
26
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12
127
16
23
22
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1.94
20114612--20114723
54
2.1
54
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3
154
16
23
22
37
1.94
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27
4.2
26
83
7
134
16
23
23
37
1.93
20122285--20122396
54
2.1
54
88
3
163
16
23
23
37
1.93
20134386--20134442
23
2.6
21
83
8
69
26
1
3
68
1.15
20134395--20134443
21
2.3
22
78
3
55
26
2
2
69
1.10
20134447--20134474
10
2.8
10
100
0
56
39
7
0
53
1.28
20135985--20136027
22
2.0
22
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16
25
4
53
1.62
20137628--20137667
18
2.4
17
87
8
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50
10
15
25
1.74
20142009--20142033
13
1.9
13
100
0
50
56
4
0
40
1.18
20145646--20145690
22
2.0
22
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0
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17
13
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1.80
20149107--20149331
40
5.6
40
84
0
279
23
26
24
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20152916--20152962
17
2.8
16
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18
51
36
12
0
51
1.40
20153063--20153111
26
1.9
25
95
4
89
18
20
12
48
1.79
20159312--20159371
27
2.2
27
79
5
68
41
11
3
43
1.57
20161271--20161317
8
5.9
8
80
5
51
61
0
36
2
1.08
20165561--20165612
2
26.0
2
100
0
104
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0
0
50
1.00
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12
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22
0
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1.32
20167070--20167126
27
2.1
27
100
0
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28
0
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1.8
93
92
0
288
22
21
28
27
1.99
20186536--20186621
25
3.4
25
76
17
97
22
13
26
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325