Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  80  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22612656--22612702
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0
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26
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1.99
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5.4
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33
22
9
34
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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4.1
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0
0
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22687139--22687226
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63
0
0
36
0.95
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0
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0
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3.5
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24
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1
205
35
14
24
25
1.93
22698597--22698699
29
3.5
29
96
2
188
36
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29
25
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22
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1.88
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66
2.5
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26
1.94
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33
5.2
32
77
4
110
36
13
23
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.89
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9
75
30
15
30
24
1.95
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50
2.2
50
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125
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29
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1.96
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0
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0
0
32
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2.6
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16
0
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55
1.41
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16
3.5
16
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21
0
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1.47
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17
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53
22
0
25
52
1.48
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17
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1
23
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2.0
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1.99
22777431--22777579
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183
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26
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47
16
0
35
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22796056--22796148
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2.1
46
88
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138
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22
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1.86
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221
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19
30
23
1.98
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3
257
26
19
30
23
1.98
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21
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1.98
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20
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0
12
35
1.40
22836993--22837040
24
2.0
24
100
0
96
25
20
8
45
1.79
22836994--22837047
24
2.2
24
93
0
90
25
22
7
44
1.79
22840955--22841034
35
2.3
34
85
8
99
38
0
31
30
1.58
22856289--22856327
10
3.8
11
83
16
57
46
0
7
46
1.31
22856289--22856328
20
2.1
19
95
4
71
47
0
7
45
1.31
22857280--22857383
22
4.7
22
76
4
93
14
25
18
42
1.88
22859755--22859801
22
2.0
24
84
8
62
38
0
4
57
1.18
22866693--22866718
12
2.2
12
100
0
52
50
7
0
42
1.31
22867245--22867276
4
8.2
4
93
6
57
25
0
28
46
1.53
22868282--22868352
35
2.0
35
89
5
108
29
23
9
36
1.87
22868325--22868446
60
2.0
60
93
0
208
30
24
15
29
1.96
22870166--22870447
144
2.0
144
84
5
374
25
29
17
27
1.97
22870115--22870447
48
6.9
48
75
3
296
25
29
18
27
1.98
22875623--22875751
46
2.8
46
91
0
195
29
27
21
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22878812--22878865
21
2.6
21
93
0
90
24
31
31
12
1.93
22881395--22881666
48
5.7
48
80
4
289
23
29
19
26
1.98
22883468--22883509
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
22884526--22884595
28
2.5
28
90
4
106
32
25
12
28
1.93
22890144--22890214
35
2.0
35
86
0
97
30
23
8
36
1.85
22890722--22890775
27
2.0
27
92
0
90
24
12
35
27
1.92
22891660--22891727
30
2.3
30
97
0
127
32
11
17
38
1.86
22891682--22891745
30
2.2
30
82
2
76
48
10
10
29
1.73
22892905--22892968
1
64.0
1
74
0
56
0
0
12
87
0.54
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5
12.2
6
84
13
83
0
0
13
86
0.57
22892904--22892965
11
6.0
11
90
9
96
0
0
14
85
0.60
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18
2.7
19
84
9
59
8
0
16
75
1.03
22896085--22896117
6
5.3
6
96
3
57
3
0
15
81
0.80
22917625--22917784
43
3.8
43
76
14
179
30
25
18
25
1.98
22917625--22917778
84
1.8
84
87
8
233
30
25
18
25
1.98
22919775--22919970
96
2.0
97
92
1
322
30
14
15
39
1.87
22922359--22922507
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
22922400--22922507
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
22930497--22930557
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
22938554--22938611
29
2.0
29
100
0
116
41
10
17
31
1.83
22953014--22953155
40
3.5
40
85
0
167
23
28
22
26
1.99
22953046--22953197
40
3.8
40
82
5
155
22
25
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22955451--22955482
16
2.0
16
100
0
64
31
12
18
37
1.88
22957260--22957843
292
2.0
292
96
0
1080
32
21
10
35
1.88
22957806--22957848
17
2.6
17
81
3
52
37
25
6
30
1.82
22962216--22962353
27
5.1
27
82
11
176
34
23
23
17
1.96
22962231--22962353
54
2.3
54
95
0
219
34
25
24
16
1.95
22962459--22962532
26
2.8
26
85
4
85
31
10
22
35
1.89
22963970--22964077
26
4.2
26
95
1
191
35
26
7
30
1.84
22968945--22968977
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
22976579--22976702
49
2.5
49
77
3
124
27
20
28
23
1.99
23005329--23005493
46
3.6
45
78
14
183
29
28
19
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325