Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  216  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66939628--66939664
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3.5
11
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3
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29
1.97
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0
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1.95
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3.0
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1
157
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21
25
27
1.99
66968496--66968637
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3.5
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6
123
28
20
25
26
1.99
66976513--66976652
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26
2.00
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308
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20
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26
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174
2.3
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524
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20
19
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66994764--66995124
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4.1
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20
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66994626--66995205
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13
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20
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3.2
42
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22
24
26
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2.4
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20
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1.82
66996591--66996747
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1.9
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83
7
203
29
11
19
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1.87
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2
263
38
6
24
29
1.81
67000381--67000621
39
6.2
39
90
0
365
24
20
32
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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3
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22
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1.99
67015704--67015886
40
4.6
40
83
3
181
23
26
22
27
1.99
67025159--67025187
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2.0
15
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20
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1.93
67037735--67037786
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2.0
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185
19
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67038003--67038127
6
20.3
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2.00
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2.0
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5.0
49
93
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29
8
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1.87
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24
2.3
24
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0
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0
0
50
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1.60
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27
23
24
2.00
67064435--67064586
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3.8
40
78
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148
22
26
23
27
1.99
67064435--67064584
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1.9
80
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22
26
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1.99
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29
5.6
29
87
0
178
27
15
32
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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14
28
27
1.96
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29
4.0
28
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14
26
25
1.94
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33
16
21
1.95
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29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
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252
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24
21
1.94
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0
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2.0
20
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1.54
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25
17
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29
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21
1.99
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28
28
21
21
1.98
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25.4
44
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3
1532
22
31
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67123021--67124117
172
6.3
173
87
4
1422
22
31
16
29
1.96
67123021--67124117
216
5.1
216
88
3
1566
22
31
16
29
1.96
67124324--67124446
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2.0
64
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191
38
12
16
33
1.85
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49
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1
501
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29
1.86
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2.6
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113
30
28
14
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1.95
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14
27
1.95
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28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
67157611--67157708
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
67161976--67162013
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
67162282--67162309
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
67162907--67162946
19
2.0
20
86
13
57
77
2
5
15
1.04
67163872--67163922
20
2.7
20
87
6
79
52
0
0
47
1.00
67173020--67173130
27
4.1
26
84
7
132
38
22
23
15
1.92
67173020--67173130
54
2.1
54
86
3
152
38
22
23
15
1.92
67180848--67180958
27
4.2
26
83
10
134
37
23
23
15
1.93
67180848--67180958
53
2.1
54
86
5
154
37
23
23
15
1.93
67186870--67187000
29
4.6
29
77
5
106
23
35
16
24
1.95
67203337--67203507
93
1.8
93
92
2
290
28
27
21
22
1.99
67203332--67203504
46
3.7
46
76
14
185
29
26
20
23
1.99
67208202--67208230
15
1.9
15
100
0
58
24
0
20
55
1.44
67208727--67208865
43
3.3
42
82
7
165
23
17
26
32
1.97
67211491--67211924
48
9.1
48
87
0
595
26
29
17
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67220251--67220622
48
7.8
49
86
4
451
27
30
17
25
1.97
67220251--67220622
96
3.9
96
89
0
521
27
30
17
25
1.97
67220251--67220621
144
2.6
144
89
1
557
27
30
17
25
1.97
67226022--67226202
50
3.6
48
80
5
191
29
25
18
25
1.98
67226019--67226202
101
1.8
101
88
2
280
29
26
18
25
1.98
67233360--67233531
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
67233352--67233527
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
67235419--67235567
39
3.8
39
78
7
133
21
26
24
26
1.99
67243484--67243632
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
67243525--67243632
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
67256249--67256358
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
67256249--67256398
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
67258621--67258796
46
3.8
46
74
14
164
22
21
27
28
1.99
67258617--67258789
93
1.9
93
88
2
267
23
21
27
27
1.99
67261316--67261390
24
3.1
24
86
0
96
18
17
20
44
1.88
67263099--67263313
46
4.6
45
76
14
188
27
20
29
22
1.98
67268162--67268294
24
5.5
24
86
3
135
26
15
21
36
1.94
67270776--67270816
21
1.9
22
85
5
57
31
24
4
39
1.76
67272877--67272954
27
2.9
27
100
0
156
34
21
10
33
1.87
67281695--67281801
52
2.0
54
85
7
148
22
23
25
28
1.99
67284774--67284838
22
3.0
21
77
11
69
73
4
0
21
1.00
67284767--67284823
6
9.7
6
79
9
55
77
3
0
19
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67285274--67285309
11
3.5
11
85
14
58
11
16
0
72
1.12
67285274--67285317
9
4.5
10
83
11
56
11
15
0
72
1.11
67285274--67285317
19
2.2
20
92
4
72
11
15
0
72
1.11
67288770--67288797
12
2.3
12
100
0
56
7
7
32
53
1.55
67288805--67289058
40
6.3
41
82
2
264
38
18
18
24
1.92
67288813--67289050
81
3.0
80
76
3
199
39
16
18
25
1.92
67288814--67289050
121
2.0
121
83
1
305
39
16
18
25
1.91
67291239--67291324
29
2.8
30
72
15
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50
4
5
39
1.47
67295823--67296011
39
4.9
39
92
3
301
23
22
31
22
1.99
67295823--67296011
76
2.4
76
92
2
306
23
22
31
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325