Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  73  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20186534--20186684
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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20249945--20250111
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192
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21
17
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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20
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26
44
20
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20364230--20364263
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2
205
24
21
25
28
1.99
20402845--20402896
26
2.0
27
85
11
72
42
5
13
38
1.68
20404021--20404140
62
1.9
62
91
0
195
22
29
18
30
1.97
20405453--20405502
26
1.9
26
91
0
82
24
24
22
30
1.99
20424333--20424382
20
2.5
20
83
0
55
36
0
2
62
1.07
20426918--20427114
50
4.0
49
80
4
216
28
26
19
25
1.98
20426933--20427115
101
1.8
99
85
2
258
29
26
19
24
1.98
20427635--20427721
42
2.1
42
97
0
165
33
19
2
44
1.63
20427639--20427706
22
3.2
22
66
29
65
29
22
1
47
1.60
20429760--20429824
15
4.4
15
78
16
73
63
13
13
9
1.53
20429760--20429826
30
2.3
30
82
15
86
61
16
13
8
1.56
20434427--20434602
46
3.8
46
79
14
209
20
20
29
29
1.98
20434424--20434595
93
1.8
93
95
2
310
20
20
29
28
1.98
20439167--20439401
28
8.3
28
69
12
131
28
14
24
32
1.94
20439164--20439401
57
4.2
55
79
7
226
28
14
24
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20439164--20439406
114
2.1
111
82
7
274
28
14
24
32
1.94
20439223--20439434
114
1.9
114
80
5
250
29
13
24
33
1.93
20455749--20455773
12
2.1
12
100
0
50
16
8
16
60
1.58
20456470--20456639
47
3.6
48
75
9
156
28
19
27
24
1.98
20456468--20456638
93
1.8
94
82
6
222
29
18
28
23
1.98
20464229--20464292
10
6.5
10
75
7
60
57
0
4
37
1.19
20464781--20464849
10
6.8
10
77
9
50
34
7
2
55
1.43
20464808--20464858
21
2.4
22
87
6
70
39
9
1
49
1.47
20465180--20465238
30
1.9
31
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10
77
54
0
1
44
1.10
20465263--20465304
5
8.4
5
100
0
84
40
0
0
59
0.97
20465307--20465396
4
22.2
4
70
15
51
70
5
22
2
1.20
20466255--20466392
40
3.5
38
75
7
125
26
15
26
32
1.95
20482849--20482901
18
2.8
19
81
10
65
24
33
0
41
1.55
20484506--20484577
37
1.9
37
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0
108
31
18
26
23
1.97
20487230--20487381
71
2.1
71
97
0
286
25
7
21
46
1.77
20493489--20493557
29
2.4
30
75
7
70
47
18
4
28
1.68
20493859--20493909
21
2.4
21
84
15
61
62
7
3
25
1.40
20499630--20499782
42
3.6
42
87
0
189
16
22
16
43
1.87
20499629--20499782
84
1.8
84
84
0
209
16
22
17
43
1.87
20499611--20499804
84
2.3
84
76
3
201
15
23
15
44
1.85
20499623--20499802
42
4.3
42
82
1
119
16
22
16
43
1.87
20502948--20503081
54
2.5
54
88
1
198
28
22
23
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20510368--20510398
10
3.1
10
90
0
53
51
16
0
32
1.44
20511189--20511234
23
2.0
23
95
0
83
54
10
0
34
1.36
20514197--20514246
24
2.2
22
82
10
64
48
2
4
46
1.32
20516622--20516662
16
2.6
16
96
0
73
48
0
36
14
1.44
20522325--20522370
2
23.0
2
95
0
83
47
0
2
50
1.13
20529716--20529763
2
24.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
20532773--20532892
43
2.8
43
90
0
186
30
26
18
25
1.98
20534700--20534775
27
2.8
27
88
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91
34
18
22
25
1.96
20534720--20534787
27
2.4
28
80
7
93
38
16
20
25
1.92
20534725--20534854
27
4.8
26
68
12
66
33
16
23
26
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325