Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  245  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.95
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4.2
40
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160
23
26
23
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0
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19
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19
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30
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28
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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22
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1.99
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20
28
29
1.98
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1.98
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22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
223
26
31
16
25
1.97
77093490--77093726
48
4.9
48
96
0
420
29
29
6
35
1.82
77096826--77096869
6
7.5
6
87
2
63
15
0
4
79
0.89
77099131--77099299
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
77102613--77102658
23
2.0
23
82
0
56
19
19
13
47
1.81
77103960--77104021
25
2.4
24
82
15
63
72
4
0
22
1.03
77109957--77110485
27
19.6
27
85
3
645
28
22
8
40
1.84
77110464--77110549
27
3.2
27
74
0
82
38
25
6
29
1.82
77111811--77111887
9
7.9
9
70
16
55
35
10
20
33
1.87
77111820--77111891
11
7.1
11
67
17
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36
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19
30
1.91
77111809--77111891
20
4.2
20
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0
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19
31
1.90
77111944--77112156
23
9.1
23
93
2
345
27
21
20
30
1.98
77111942--77112177
94
2.5
93
91
4
366
27
21
21
29
1.98
77114171--77114347
47
3.8
48
79
7
193
29
19
29
22
1.98
77114171--77114347
94
1.9
94
89
0
273
29
19
29
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77117803--77118021
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4.7
46
79
5
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29
26
20
23
1.99
77117810--77117980
93
1.8
93
89
2
272
28
26
21
23
1.99
77118409--77118479
24
3.0
24
93
4
117
36
1
38
23
1.64
77118409--77118502
48
1.9
48
81
10
111
36
4
37
22
1.74
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27
4.1
27
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15
24
23
37
1.93
77119895--77120006
54
2.1
54
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163
15
24
23
37
1.93
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24
3.0
24
95
0
124
35
1
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1.65
77126255--77126348
48
1.9
48
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10
111
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4
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23
1.75
77127745--77127856
27
4.1
27
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138
15
24
23
37
1.93
77127745--77127856
54
2.1
54
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3
163
15
24
23
37
1.93
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2.0
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100
0
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1.91
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2
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2
100
0
50
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0
0
52
1.00
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2.2
23
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6
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70
1
5
21
1.18
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2
22.0
2
95
0
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2
0
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21
1.9
20
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51
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12
23
1.74
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40
1.9
40
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0
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1.91
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20
3.2
20
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8
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14
1.90
77148754--77148819
20
3.3
20
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0
60
37
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1.92
77149642--77149717
38
2.0
38
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0
143
38
10
17
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1.84
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2
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2
100
0
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0
50
0
1.00
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2.0
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0
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19
27
1.85
77163361--77163423
31
2.0
31
100
0
126
28
15
9
46
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77169726--77169776
25
2.0
25
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0
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21
23
17
37
1.94
77172139--77172318
40
4.6
38
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12
132
25
26
21
27
1.99
77172139--77172272
40
3.4
40
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10
134
25
26
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29
1.99
77177028--77177084
29
2.0
29
85
0
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24
12
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1.91
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2
20.5
2
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4
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50
0
2
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1.14
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18
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0
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0
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18
2.2
19
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8
68
14
9
16
59
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325