Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  319  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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141
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2
0
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1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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1.92
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15
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16
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1
78
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96702879--96702965
26
3.4
26
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7
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16
4
1
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0.98
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30
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62
65
5
5
25
1.34
96732040--96732087
20
2.4
19
80
10
51
33
8
2
56
1.41
96734905--96734971
11
6.2
11
82
3
82
31
14
19
34
1.92
96734912--96734973
21
2.9
21
83
11
72
32
11
20
35
1.88
96738828--96738921
44
2.1
44
96
0
170
32
21
13
31
1.92
96738825--96739044
123
1.8
118
91
6
363
32
21
11
34
1.89
96738930--96739053
51
2.4
51
91
0
194
32
24
9
33
1.88
96740252--96740374
51
2.4
51
86
2
158
29
20
9
40
1.84
96740895--96740943
26
2.0
26
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20
8
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69
1.24
96741803--96742076
137
2.0
137
87
1
397
30
16
16
36
1.91
96743581--96743635
21
2.5
22
76
5
58
12
3
29
54
1.55
96756061--96756105
22
2.0
22
82
0
54
57
11
11
20
1.63
96756550--96756579
2
15.0
2
92
0
51
53
0
46
0
1.00
96759544--96759593
25
2.0
25
96
0
91
26
4
22
48
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96760996--96761105
53
2.1
54
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1
204
34
25
14
25
1.94
96766471--96766519
24
2.0
24
100
0
98
26
24
8
40
1.83
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8
3.4
8
100
0
54
11
22
0
66
1.22
96779177--96779283
31
3.5
31
67
12
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42
10
18
28
1.83
96782548--96782615
31
2.3
31
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12
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66
2
0
30
1.07
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9
4.1
9
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14
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25
0
0
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0.82
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16
2.0
16
100
0
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0
0
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2.0
25
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0
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1.20
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2.0
23
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0
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19
2.0
20
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9
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2
0
14
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2.3
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0
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0
0
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2.0
21
90
0
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29
21
29
19
1.98
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7
100
0
50
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0
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1.46
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2.2
16
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5
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50
5
0
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1.26
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24
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0
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1.79
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24
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28
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33
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1.78
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2
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2
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0
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50
0
0
50
1.00
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239
2.9
239
92
1
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31
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21
35
1.90
96819660--96819787
59
2.1
60
88
2
186
45
2
4
47
1.36
96819682--96819784
31
3.4
31
72
12
88
43
2
3
49
1.35
96819771--96819811
20
2.0
20
86
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57
39
2
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51
1.43
96819973--96820003
16
1.9
16
93
0
53
51
6
9
32
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96830230--96830292
28
2.2
28
75
13
67
31
1
1
65
1.12
96831588--96831659
30
2.4
29
80
17
76
27
11
4
56
1.52
96832120--96832243
54
2.2
58
78
13
134
26
15
15
42
1.86
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25
3.0
25
75
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24
2
5
67
1.25
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2.0
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235
38
17
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34
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9
10.4
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79
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2
0
32
1.05
96841822--96841916
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5.2
19
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2
0
32
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2
0
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1.04
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56
0
0
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0.99
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19
2.0
20
90
4
64
30
10
0
60
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325