Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  71  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19605868--19605898
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0
0
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2.9
24
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23
20
19
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20
3.2
19
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2
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30
6
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0
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2.0
20
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25
0
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2
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2
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60
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0
0
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0
0
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19617370--19617500
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11
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70
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221
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0
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18
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44
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170
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12
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2
12
0
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0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19619687--19619735
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61
0
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59
0
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0
0
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0
0
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19626057--19626181
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2.3
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2
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5
20
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1.9
24
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62
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4
10
46
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
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0
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14
3.0
14
80
13
50
40
2
0
57
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19745343--19745373
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1.9
16
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35
14
14
36
1.86
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0
0
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30
80
12
77
64
7
0
27
1.20
19766066--19766096
16
2.0
16
93
6
55
38
0
0
61
0.96
19766084--19766125
19
2.4
17
78
17
50
59
0
2
38
1.10
19779778--19779845
32
2.1
32
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10
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48
1
7
42
1.40
19783816--19783882
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70
4
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44
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20
17
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19783787--19783900
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2.8
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21
1.90
19785634--19785867
27
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27
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1
310
26
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10
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1.85
19785617--19785878
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19785646--19785896
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27
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25
1.96
19787195--19787255
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20
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0
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19787305--19787471
24
7.0
23
92
4
246
29
22
22
26
1.99
19787305--19787471
47
3.5
46
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6
246
29
22
22
26
1.99
19787662--19787725
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1
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10
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3.2
81
81
2
285
29
21
9
39
1.85
19790574--19790824
81
3.1
80
82
4
290
27
21
10
41
1.86
19792034--19792081
25
1.9
25
86
0
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33
25
16
25
1.96
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3.0
20
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0
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21
32
1.89
19792234--19792400
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7.0
23
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4
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29
22
22
26
1.99
19792234--19792400
47
3.5
46
90
6
246
29
22
22
26
1.99
19792590--19792653
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
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5.1
11
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3
0
28
1.06
19794325--19794381
23
2.5
23
74
20
66
68
3
0
28
1.06
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2.0
21
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0
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
26
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1.01
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2.4
24
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0
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19
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2.1
19
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0
2
35
1.10
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2.1
19
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0
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7.5
6
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14
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79
0
2
18
0.83
19811680--19811721
17
2.4
17
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80
0
2
16
0.81
19811680--19811723
23
1.9
23
86
9
63
79
0
2
18
0.83
19815356--19815405
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5.0
10
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4
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20
1.32
19815422--19815451
13
2.4
12
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5
51
46
13
0
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1.43
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17
1.9
17
88
11
50
45
3
12
39
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19817399--19817494
50
1.9
51
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2
122
23
33
9
33
1.87
19819138--19819183
24
1.9
24
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32
4
4
58
1.37
19820145--19820170
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2
100
0
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0
0
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0
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0
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0
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0
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0
0
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19831201--19831230
15
1.9
16
93
6
53
46
0
0
53
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325