Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  232  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72574247--72574327
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2
115
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1.92
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2.0
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30
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24
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1.97
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3.5
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1.86
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60
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18
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9
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2.0
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22
2.1
22
95
0
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28
2
21
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
3.1
27
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19
1.94
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4.2
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26
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1.99
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1.99
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2
305
25
24
28
21
1.99
72658230--72658397
40
4.2
40
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2
196
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25
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10
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2.0
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2
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26
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29
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3.5
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1.98
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1.8
93
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263
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20
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54
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0
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50
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4.9
40
90
4
278
26
21
25
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
24
27
1.99
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1.9
120
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271
26
21
25
26
1.99
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18
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1.97
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2.9
20
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20
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1.90
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20
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1.90
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20
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1.98
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1.97
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114
22
28
16
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.00
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26
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23
15
39
1.91
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3.6
28
81
6
116
21
16
32
29
1.95
72823623--72823725
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
72827042--72827080
16
2.4
16
91
0
60
0
30
0
69
0.89
72827147--72827183
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
72829359--72829469
40
2.8
40
85
0
159
24
26
23
26
2.00
72829344--72829513
80
2.1
80
82
6
211
27
26
21
24
2.00
72833200--72833360
39
4.2
39
91
4
254
26
33
17
22
1.96
72833200--72833360
76
2.1
78
90
3
254
26
33
17
22
1.96
72836335--72836615
46
6.0
44
74
19
200
25
16
30
26
1.97
72836344--72836615
94
2.9
95
78
15
307
25
17
30
26
1.97
72836347--72836604
140
1.8
141
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8
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26
16
30
26
1.97
72850388--72850517
40
3.2
40
82
4
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23
24
28
23
2.00
72850351--72850517
80
2.1
79
81
7
196
25
23
27
23
2.00
72858168--72858392
124
1.8
124
85
1
317
30
11
23
34
1.90
72858387--72858516
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72858349--72858516
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2.1
80
81
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25
23
27
23
2.00
72867227--72867310
29
3.0
29
84
3
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28
28
14
28
1.95
72869481--72869743
56
4.7
56
90
1
386
27
15
24
32
1.96
72875015--72875222
40
5.2
40
86
1
256
25
20
25
28
1.99
72875017--72875249
80
2.9
80
80
4
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26
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25
27
1.99
72887972--72888147
46
3.8
46
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14
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20
19
28
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1.97
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1.8
93
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0
254
20
19
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1.97
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2.0
47
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0
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35
7
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1.83
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1.9
16
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0
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0
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1.54
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2.0
20
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0
53
37
22
0
40
1.54
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3.9
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1.9
16
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0
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38
19
0
41
1.51
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20
2.0
20
85
0
53
40
20
0
40
1.52
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23
1.9
24
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4
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22
22
11
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108
1.8
110
85
6
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23
25
16
34
1.95
72898579--72898833
55
4.8
55
77
10
230
21
25
16
36
1.94
72902269--72902314
23
2.1
22
84
11
60
41
10
10
36
1.75
72904554--72904666
59
1.9
59
96
0
208
31
8
19
39
1.82
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39
7.1
39
91
0
453
23
28
25
22
1.99
72917601--72917769
45
3.7
45
77
14
195
28
27
21
22
1.99
72917606--72917773
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1.8
92
93
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295
28
27
21
22
1.99
72918189--72918248
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72921533--72921563
16
1.9
16
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0
53
35
22
0
41
1.54
72921530--72921569
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
72921755--72922009
55
4.8
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265
21
25
18
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1.95
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108
1.8
110
89
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312
22
25
17
33
1.96
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28
3.5
28
86
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28
13
27
29
1.95
72930478--72930549
29
2.5
28
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110
29
13
27
29
1.95
72932128--72932158
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16
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0
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20
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2.4
23
100
0
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19
23
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1.77
72932348--72932602
55
4.8
54
79
7
247
21
25
17
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325