Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  29  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6757687--6757784
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1.24
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0
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0
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22
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0
15
43
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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2.3
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2.0
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0
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19
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32
0
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0
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20
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23
73
16
106
53
4
7
35
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
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2
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1.18
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41
2.4
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8
110
62
2
2
33
1.18
6831302--6831368
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14
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18
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1
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1.12
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12
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11
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59
2
5
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1.33
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61
1
6
30
1.31
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22
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1.18
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20
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5
0
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1.22
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20
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34
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2
5
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68
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5
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9
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1.01
6831674--6831712
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16
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8
53
76
0
2
20
0.90
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1.9
40
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36
22
23
18
1.95
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22
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18
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1.94
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16
21
18
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1
21
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1.58
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15
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16
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10
72
51
1
20
26
1.56
6852083--6852126
21
2.2
20
83
4
52
54
4
11
29
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6852090--6852131
20
2.0
21
86
4
59
52
4
7
35
1.50
6852189--6852329
26
5.8
25
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111
54
4
7
34
1.47
6852181--6852346
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3.4
51
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10
143
56
4
6
33
1.45
6852293--6852373
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2.1
38
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1
2
32
1.15
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11
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13
61
64
2
2
30
1.20
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11
26.9
11
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59
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5
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2
5
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1.33
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17
71
22
79
62
2
3
32
1.25
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21
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62
3
5
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1.32
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3
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11
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0
5
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1.27
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27
2.5
27
80
2
71
60
1
9
28
1.36
6854045--6854138
27
3.5
26
72
15
75
58
4
7
29
1.45
6854791--6854836
14
3.5
14
77
17
62
65
2
0
32
1.05
6863756--6863931
46
3.8
45
79
10
212
21
20
28
28
1.98
6863753--6863923
93
1.8
93
94
0
306
21
21
29
28
1.98
6869159--6869186
5
5.6
5
100
0
56
64
0
0
35
0.94
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2
15.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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17
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17
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8
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58
0
2
40
1.10
6874015--6874048
9
3.9
9
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7
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58
0
0
41
0.98
6876114--6876164
16
3.4
16
75
25
58
29
21
5
43
1.76
6877433--6877467
12
2.9
12
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0
52
40
2
40
17
1.64
6886304--6886355
22
2.4
22
90
0
77
13
28
30
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6888253--6888294
15
2.9
15
86
10
61
28
7
0
64
1.20
6893796--6893832
14
2.6
15
83
12
51
37
5
0
56
1.22
6893810--6893865
24
2.2
26
78
15
64
39
3
0
57
1.16
6904151--6904205
24
2.3
25
81
9
69
69
3
12
14
1.33
6905849--6905902
20
2.8
20
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10
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1
50
0
1.11
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1.9
40
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10
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1
44
1
1.17
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13
2.2
13
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0
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21
1.93
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25
2.0
25
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0
100
28
20
20
32
1.97
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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0
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17
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1.90
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2.2
15
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0
3
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1.15
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5.7
14
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10
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38
8
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36
1.79
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26
3.0
26
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7
84
38
7
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36
1.78
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20
2.7
20
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62
5
0
32
1.19
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39
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18
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1.96
6937510--6937546
7
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7
100
0
74
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0
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1.40
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2.2
20
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4
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22
0
0
77
0.77
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18
2.4
17
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4
57
11
0
23
64
1.27
6940622--6940877
131
2.0
129
88
1
386
28
19
17
34
1.94
6951779--6952516
133
5.6
133
89
0
1059
27
20
24
28
1.99
6951779--6952479
265
2.6
264
90
1
1080
27
19
24
28
1.99
6952270--6952516
45
5.6
45
71
4
135
26
19
24
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6953631--6953692
32
2.0
32
83
3
81
12
11
30
45
1.78
6955067--6955322
131
2.0
130
88
0
377
27
18
18
35
1.95
6959056--6959144
14
6.5
13
69
14
54
19
2
5
73
1.14
6959106--6959153
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2.0
24
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4
62
18
4
4
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1.17
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2.1
13
100
0
54
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7
0
22
1.12
6966943--6967034
3
32.0
3
73
16
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65
1
30
3
1.16
6966943--6967054
28
4.1
28
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16
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63
0
31
4
1.20
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2.3
31
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23
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21
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0
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29
1.99
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19
2.6
18
83
10
51
12
10
0
76
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325