Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  54  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14089344--14089387
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0
0
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17
29
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1.98
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29
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1.98
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2.4
24
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24
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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13
0
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0
0
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0
0
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54
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13
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0
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26
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4.2
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185
24
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22
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23
2.3
23
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40
3
0
55
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18
2.9
18
80
11
61
54
1
1
41
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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116
29
19
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25
1.99
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2.1
18
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0
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1.94
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2.5
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124
28
14
27
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14232463--14232544
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29
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25
2.2
25
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69
39
17
28
14
1.89
14266927--14267034
50
2.2
50
77
12
114
37
15
28
18
1.92
14266939--14267032
25
3.8
25
75
8
84
35
15
30
18
1.92
14270996--14271122
42
3.0
41
80
4
155
29
15
24
29
1.96
14279430--14279495
26
2.4
27
80
14
82
66
3
0
30
1.06
14279446--14279500
24
2.4
22
77
19
58
69
1
0
29
0.99
14279600--14279628
14
2.1
14
100
0
58
48
0
20
31
1.50
14279903--14279963
27
2.2
28
85
8
81
36
0
3
60
1.13
14280523--14280552
15
2.0
15
100
0
60
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0
0
66
0.92
14280537--14280603
29
2.3
30
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2
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41
0
8
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1.34
14280537--14280601
30
2.2
30
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5
78
41
0
9
49
1.35
14281098--14281127
11
2.9
10
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9
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13
0
0
86
0.57
14285178--14285203
4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
14290448--14290650
79
2.6
80
86
6
281
24
23
26
25
2.00
14290452--14290652
40
5.1
40
88
4
277
23
23
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14298498--14298713
40
5.4
40
87
2
240
24
23
28
24
2.00
14298492--14298699
80
2.6
80
88
3
294
23
23
28
25
2.00
14300580--14300611
16
2.0
16
93
0
55
37
3
9
50
1.51
14301161--14301191
16
2.0
15
93
6
53
90
0
9
0
0.46
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21
2.1
21
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0
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60
13
6
20
1.55
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24
2.0
24
100
0
98
16
32
16
34
1.91
14315069--14315152
31
2.7
30
83
12
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38
7
0
54
1.28
14315100--14315211
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2.2
51
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6
0
56
1.31
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2.7
72
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225
37
5
1
56
1.31
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121
2.8
119
94
1
554
35
4
2
57
1.32
14315149--14315257
34
3.1
34
71
19
98
35
4
2
56
1.34
14315191--14315320
51
2.5
51
88
2
181
36
3
2
56
1.30
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19
15.1
15
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25
79
35
3
2
58
1.29
14315145--14315292
70
2.1
69
83
7
183
37
4
2
56
1.33
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35
3.0
35
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110
36
3
0
58
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20
2.1
21
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30
0
2
67
1.03
14315247--14315418
68
2.5
69
82
8
199
36
4
1
56
1.30
14315327--14315429
51
2.1
49
90
3
161
35
3
2
57
1.32
14317534--14317633
18
5.6
18
82
0
110
33
17
15
35
1.90
14317522--14317633
36
3.1
35
80
2
125
34
16
14
33
1.89
14319060--14319106
19
2.5
19
86
6
69
8
14
4
72
1.24
14319260--14319292
5
6.6
5
100
0
66
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14319260--14319315
20
2.7
22
86
10
75
53
0
0
46
1.00
14319463--14319500
20
1.9
20
88
0
58
39
13
5
42
1.66
14320937--14321039
52
2.0
52
96
0
188
35
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27
1.93
14323079--14323134
6
9.3
6
88
7
87
83
0
14
1
0.72
14323238--14323315
30
2.7
26
80
18
84
73
2
1
23
1.03
14323230--14323319
4
22.2
4
69
29
50
73
2
1
23
1.01
14324218--14324296
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2.0
39
92
0
131
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15
7
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1.74
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2.0
585
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0
1989
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14
33
1.92
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10
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12
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1.50
14350232--14350289
30
1.9
30
82
0
71
13
25
36
24
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325