Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  85  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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26
17
30
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.47
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23
2.0
23
81
0
54
42
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6
40
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24514108--24514350
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17
40
1.60
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20
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1.95
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116
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0
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29
1.55
24520766--24520817
11
4.9
11
86
9
81
44
0
26
28
1.55
24520766--24520829
31
2.1
31
88
5
94
43
0
25
31
1.55
24547169--24547210
21
2.0
21
86
4
59
33
2
7
57
1.39
24547168--24547212
20
2.2
20
80
7
56
31
2
6
60
1.35
24550196--24550223
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
24556009--24556180
54
3.2
54
87
0
227
26
21
15
36
1.93
24556161--24556389
42
5.5
43
73
5
128
22
23
13
40
1.89
24556506--24556640
54
2.5
54
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1
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26
20
15
37
1.92
24556657--24556833
54
3.3
54
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0
210
26
18
15
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1.90
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42
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40
1.90
24556823--24557087
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3.2
84
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263
21
23
14
40
1.90
24556009--24557203
654
1.8
654
81
1
1509
24
21
14
39
1.91
24558904--24559017
43
2.7
43
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2
131
31
24
15
28
1.96
24559810--24559931
54
2.3
54
80
0
145
27
19
15
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24559909--24560079
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4.1
41
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6
132
24
21
13
40
1.89
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78
1.9
78
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0
230
23
19
17
39
1.92
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54
4.0
54
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3
238
25
18
14
40
1.89
24560396--24560609
106
2.0
107
82
4
263
25
19
14
40
1.90
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93
3.1
93
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2
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22
20
16
40
1.91
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39
2.4
39
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0
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22
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1.92
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28
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1
1
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15
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0
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2.6
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7
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1.31
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18
1.9
18
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26
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21
2.8
21
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10
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6
75
1.20
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22
3.4
22
77
11
78
12
10
6
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1.35
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22
2.2
22
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7
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27
10
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1.27
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22
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1.38
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2.0
21
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21
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8
24
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1.51
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46
3.8
46
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20
21
29
28
1.98
24591907--24592078
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
24597280--24597315
11
3.4
11
88
7
56
11
5
2
80
0.98
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10
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10
100
0
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7
0
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0.73
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26
2.3
24
74
20
59
60
10
3
26
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24599781--24599842
34
1.9
32
87
9
90
58
11
1
29
1.42
24599829--24599906
12
6.7
12
72
17
58
69
6
1
23
1.19
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43
3.9
43
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15
25
33
1.95
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10
232
20
21
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1.98
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1.8
93
96
0
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20
22
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1.98
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15
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0
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3.0
30
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10
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20
21
29
28
1.98
24614163--24614334
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1.8
93
96
0
317
20
22
30
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1.98
24615636--24615662
14
1.9
14
100
0
54
22
14
40
22
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325