Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  26  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6059098--6059164
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0
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0
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152
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128
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2
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6089429--6089516
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1.28
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20
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9
57
36
2
2
59
1.23
6089849--6089907
20
2.9
21
77
10
68
38
0
3
57
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6089831--6089922
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1
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0
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2.2
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0
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0
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4
50
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4
100
0
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0
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2.0
33
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2
125
25
12
6
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2.2
33
87
9
112
26
12
2
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2.6
13
85
9
50
30
0
3
66
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
0
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0.98
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1
0
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24
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0
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0
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2.1
132
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0
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25
21
21
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3.9
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20
29
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132
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23
19
29
1.98
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2.1
309
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1.9
486
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22
20
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1.98
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0
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0
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28
0
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6161134--6161244
51
2.2
50
78
10
118
4
28
0
65
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6161914--6161960
24
2.0
24
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4
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1.62
6167847--6167898
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2.5
22
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63
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1
0
28
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23
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54
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36
23
23
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2.0
24
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30
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21
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26
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26
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5
149
36
23
23
16
1.94
6176458--6176572
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2.1
54
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169
36
23
23
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13
7
58
1.59
6179344--6179407
17
3.4
19
80
10
60
18
10
7
62
1.51
6179410--6179460
18
2.8
19
77
14
54
35
0
1
62
1.06
6179429--6179461
9
3.7
9
91
0
57
30
0
3
66
1.06
6179410--6179461
15
3.2
16
83
10
61
34
0
1
63
1.06
6179896--6179935
12
3.6
12
83
12
50
30
5
0
65
1.14
6180082--6180127
23
2.0
22
83
4
56
36
10
8
43
1.71
6181313--6181595
134
2.1
137
95
2
511
31
25
18
24
1.97
6181843--6181895
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
6183375--6183483
26
4.2
26
94
1
175
36
23
5
33
1.78
6187181--6187465
135
2.1
137
96
1
520
31
25
18
24
1.97
6189237--6189345
26
4.2
26
92
2
175
36
23
5
33
1.78
6189237--6189345
51
2.1
52
91
1
175
36
23
5
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6198972--6199109
71
2.0
70
86
1
195
28
15
23
32
1.95
6198876--6199427
257
2.1
258
95
0
1007
28
18
19
34
1.95
6199229--6199366
71
1.9
71
89
0
213
30
17
22
29
1.97
6199377--6199591
54
4.0
54
88
3
315
30
15
16
37
1.90
6201518--6201581
3
21.0
3
96
3
119
32
0
1
65
1.02
6201780--6201818
15
2.5
15
87
4
51
33
2
2
61
1.23
6204180--6204213
17
1.9
18
88
5
52
41
0
8
50
1.34
6205069--6205104
16
2.2
17
90
9
58
61
2
0
36
1.11
6206143--6206203
25
2.4
25
82
15
65
49
0
0
50
1.00
6206713--6206746
16
2.0
18
88
11
54
20
0
8
70
1.13
6208344--6208403
28
2.1
28
84
6
77
33
8
26
31
1.86
6214524--6214607
26
3.2
26
91
3
134
38
26
3
32
1.73
6216834--6216896
28
2.2
28
91
0
99
31
6
30
31
1.83
6218806--6218853
15
3.3
15
77
11
55
16
0
33
50
1.46
6218861--6218919
22
2.7
22
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5
75
22
0
33
44
1.53
6218820--6218912
7
13.0
7
71
8
62
21
0
36
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1.53
6222007--6222072
21
3.0
21
72
16
62
56
3
1
39
1.24
6222087--6222228
43
3.3
44
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3
218
21
21
30
26
1.98
6223729--6223765
3
12.3
3
100
0
74
32
35
32
0
1.58
6225057--6225117
21
2.8
22
72
7
61
49
1
1
47
1.21
6227417--6227450
17
1.9
18
94
5
61
20
5
0
73
1.04
6227455--6227489
2
17.5
2
87
0
52
45
2
2
48
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6230360--6230392
15
2.1
16
88
5
50
15
21
18
45
1.85
6232215--6232310
26
3.3
28
77
14
88
23
5
11
59
1.52
6232228--6232284
26
2.2
25
88
11
89
24
3
10
61
1.44
6236606--6236636
15
2.1
15
100
0
62
48
12
25
12
1.77
6237339--6237407
33
2.1
33
100
0
138
36
5
2
55
1.39
6239722--6239776
27
2.0
27
96
0
101
40
14
18
27
1.89
6253357--6253409
26
2.0
26
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7
63
26
15
20
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6253670--6253713
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5.5
8
86
7
63
4
20
20
54
1.62
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26
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0
198
35
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1.84
6256704--6256747
3
14.7
3
100
0
88
34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325