Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  244  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76444325--76444435
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6
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183
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55
5
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0
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1.18
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40.0
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0
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0
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210
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2.0
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1.97
76526488--76527127
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9.1
70
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0
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24
18
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
100
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2.2
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2.1
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2.1
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26
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1.99
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80
2.6
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234
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22
25
25
2.00
76535406--76535612
40
5.2
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197
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22
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2.00
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1.95
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2.1
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2.3
28
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2
85
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15
1
35
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.20
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12
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3
30
1.17
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18
3.2
18
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13
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1
3
31
1.20
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25
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27
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1
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1.20
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20
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2.0
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86
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21
20
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76611502--76611672
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33
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192
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24
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1.90
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23
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1.90
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21
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1.99
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46
2.7
44
81
11
122
25
26
15
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76631180--76631229
24
2.1
23
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3
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28
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0
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0
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1.70
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61
3
0
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1.13
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2.2
17
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21
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68
1.28
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29
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0
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418
22
20
29
27
1.98
76659762--76659890
40
3.2
40
81
6
145
23
22
28
25
1.99
76667197--76667295
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
76668949--76669148
27
7.4
27
82
4
179
25
19
18
37
1.94
76668950--76669144
54
3.6
54
82
0
246
25
18
18
37
1.94
76668963--76669144
81
2.2
81
84
0
238
25
18
19
37
1.94
76675647--76675839
39
4.9
39
90
0
251
23
31
21
23
1.98
76675677--76675839
39
4.2
39
93
0
263
24
31
20
23
1.98
76683649--76683811
39
4.2
39
92
0
254
24
32
20
22
1.98
76703733--76703800
27
2.5
27
95
2
118
30
26
13
29
1.94
76706609--76706651
19
2.2
20
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34
16
9
39
1.80
76707335--76707786
166
2.7
166
86
8
595
25
21
21
31
1.98
76707638--76707776
43
3.3
42
70
17
135
27
20
21
30
1.98
76707335--76707786
84
5.4
84
85
8
588
25
21
21
31
1.98
76708726--76708782
1
57.0
1
85
0
69
0
8
0
91
0.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76714389--76714454
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
76714406--76714502
19
5.2
19
90
9
155
35
16
10
38
1.83
76714406--76714502
35
2.6
37
88
11
153
35
16
10
38
1.83
76715641--76715906
70
3.8
70
80
2
284
27
20
19
32
1.97
76715640--76715898
140
1.9
140
84
1
349
27
20
19
32
1.96
76719110--76719182
36
2.0
36
94
0
128
30
31
20
17
1.96
76726985--76727138
40
3.9
38
77
7
146
35
28
18
17
1.93
76726976--76727138
80
2.1
79
86
1
227
36
28
17
17
1.93
76728701--76728740
17
2.4
16
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4
53
12
5
5
77
1.09
76729825--76729861
16
2.4
16
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4
67
37
10
0
51
1.37
76734423--76734725
151
2.0
151
96
1
554
28
13
25
32
1.94
76741505--76741544
21
1.9
21
94
0
71
17
37
17
27
1.92
76741963--76742005
19
2.3
19
84
8
52
44
23
2
30
1.66
76742383--76742563
40
4.5
40
79
3
159
34
27
22
16
1.95
76742383--76742564
80
2.3
81
83
5
244
34
26
22
15
1.95
76744826--76744876
23
2.2
24
82
3
59
64
7
9
17
1.46
76745870--76746020
35
4.3
35
82
2
187
33
22
9
34
1.87
76745867--76746020
70
2.2
70
88
2
220
33
22
9
34
1.87
76750783--76750811
10
2.9
10
100
0
58
0
10
0
89
0.48
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21
4.0
23
71
10
69
38
26
20
14
1.91
76762956--76763048
28
3.5
24
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13
89
47
32
4
16
1.66
76762968--76763051
28
3.0
28
91
1
132
46
30
3
19
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76773865--76773974
31
3.5
32
75
16
106
27
9
18
45
1.79
76773921--76774057
31
4.4
31
75
11
111
27
11
16
45
1.81
76773865--76774034
93
1.8
93
85
2
243
27
10
17
44
1.81
76780602--76780630
2
14.5
2
100
0
58
51
0
48
0
1.00
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
76798294--76798337
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19
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0
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11
1.70
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0
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2
0
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0.79
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18
2.5
18
92
0
72
17
53
4
24
1.62
76802066--76802168
29
3.6
28
80
5
116
21
16
33
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325