Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  30  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6981731--6981789
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7028702--7028811
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2.1
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20
2.0
20
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1
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2.7
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1
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1
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2
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14
2.5
15
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16
5
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63
1.47
7044291--7044328
15
2.5
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62
15
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13
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1.43
7044289--7044362
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100
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1.00
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100
0
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32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.99
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27
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22
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1.99
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20
19
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43
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5
163
27
20
20
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7125378--7125417
11
3.6
11
82
0
53
22
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1.57
7126241--7126306
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105
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1.87
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2.0
21
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0
0
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1.62
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78
2.0
78
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12
29
17
1.87
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0
0
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7139917--7140020
53
2.0
53
88
3
156
29
13
24
32
1.93
7140562--7140604
21
2.2
21
84
15
58
30
4
20
44
1.72
7140562--7140606
18
2.3
20
78
17
51
31
4
20
44
1.71
7140838--7140890
20
2.7
20
81
0
61
24
33
28
13
1.93
7144849--7144881
7
4.6
7
92
7
57
42
0
0
57
0.98
7145892--7145924
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
7148160--7148220
31
2.0
31
93
3
106
39
8
13
39
1.74
7151322--7151355
17
2.0
17
94
0
59
26
32
5
35
1.81
7151848--7151934
36
2.4
37
81
12
101
36
0
16
47
1.47
7151984--7152010
13
2.1
13
100
0
54
37
11
0
51
1.37
7155165--7155194
11
2.8
11
95
5
53
16
0
0
83
0.65
7159596--7159624
13
2.1
14
93
6
51
13
3
0
82
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7166349--7166481
41
3.3
41
91
3
216
34
22
24
18
1.96
7167211--7167255
19
2.3
20
92
3
74
68
2
4
24
1.19
7168135--7168213
8
10.6
7
87
6
95
70
3
1
24
1.11
7168143--7168213
23
3.0
23
84
10
83
71
4
0
23
1.03
7168135--7168213
15
5.3
15
87
6
99
70
3
1
24
1.11
7168369--7168478
41
2.7
41
84
1
141
35
13
21
29
1.92
7174651--7174698
20
2.4
21
82
10
64
25
0
6
68
1.12
7174639--7174698
20
3.1
20
77
13
63
25
0
5
70
1.08
7175329--7175387
30
2.0
30
83
6
75
28
25
30
15
1.96
7175892--7175932
21
2.0
21
85
0
55
17
9
46
26
1.79
7175997--7176066
24
3.0
23
74
14
70
14
11
35
38
1.82
7178339--7178540
103
2.0
103
98
0
395
28
21
18
31
1.97
7182242--7182290
25
1.9
25
84
12
64
40
0
0
59
0.98
7189180--7189249
30
2.4
30
80
4
81
28
14
21
35
1.92
7200458--7200482
10
2.5
10
100
0
50
48
0
8
44
1.32
7209427--7209485
29
2.0
29
100
0
118
20
23
25
30
1.98
7224696--7224781
31
2.9
30
72
14
79
36
10
11
41
1.76
7226923--7226962
18
2.2
18
90
0
62
55
10
10
25
1.64
7233514--7233560
22
2.2
21
88
3
67
31
0
0
68
0.90
7235032--7235065
12
2.8
12
86
0
50
8
17
50
23
1.74
7243390--7243449
30
2.0
30
90
6
95
38
6
26
28
1.81
7244097--7244343
49
5.0
50
83
2
300
27
18
25
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7249999--7250044
16
2.8
16
86
3
56
45
6
0
47
1.28
7250009--7250044
17
2.2
16
90
5
54
44
8
0
47
1.33
7259130--7259192
31
2.0
32
84
9
85
46
0
4
49
1.23
7259443--7259505
28
2.2
28
91
0
99
31
6
30
31
1.83
7266459--7266492
16
2.1
16
89
10
52
55
0
8
35
1.31
7266608--7266641
6
5.5
6
86
6
50
17
20
17
44
1.87
7266737--7266761
6
4.2
6
100
0
50
16
16
16
52
1.76
7266881--7267068
18
10.4
18
75
10
143
37
11
15
35
1.84
7267107--7267147
18
2.3
18
86
0
55
36
12
17
34
1.87
7266866--7267163
36
8.1
36
70
13
151
36
11
15
36
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325