Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  1  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
747--1235
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131
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4
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18
19
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5
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0
0
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26
0
0
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0.83
1904--1947
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3.1
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83
9
63
34
9
0
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1968--2013
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29
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20
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1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
11678--11853
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3.8
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12
216
28
29
21
20
1.98
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0
0
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17667--17792
46
2.8
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33030--33199
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4.2
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225
25
24
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21
1.99
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2.5
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2
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14
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1.95
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27
2.5
28
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2
106
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0
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0
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1.00
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3.0
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1.8
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94
0
308
28
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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12
207
29
28
21
20
1.98
55731--55869
47
3.0
46
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16
144
29
28
19
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1.98
58450--58479
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0
0
50
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61715--61840
46
2.8
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10
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6
20
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62172--62241
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2.2
32
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0
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2.2
18
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0
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7
22
1.38
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6
0
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0
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0
0
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5.8
132
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0
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23
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29
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190
29
23
17
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1.97
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220
30
23
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93742--93854
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2.8
40
98
0
217
23
20
29
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
201
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20
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28
1.98
105705--105747
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2.1
21
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12
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44
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18
25
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2.2
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7
22
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4.4
15
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78
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57
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23
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0
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0
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0
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7
57
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0
0
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9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
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2.0
38
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5
100
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3
2
25
1.20
148632--148674
12
3.5
12
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50
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4
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148897--148979
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148897--148983
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16
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149269--149371
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899
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23
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
149830--151199
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2.8
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22
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1.97
150021--150874
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264
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22
18
32
1.97
151257--151455
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2.9
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294
27
21
23
28
1.99
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11
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132
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22
21
34
1.96
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10.3
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20
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21
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22
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5
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21
22
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34
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12
19
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59
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1
4
30
1.22
158408--158491
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4.3
20
73
19
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63
1
4
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25
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20
1.56
169960--170000
16
2.6
16
84
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57
26
36
21
14
1.93
170142--170176
16
2.2
16
94
0
61
51
34
5
8
1.56
171805--171947
71
2.0
71
95
0
259
40
6
25
26
1.81
184570--184616
24
2.0
24
91
0
76
31
44
8
14
1.76
184570--184624
24
2.3
24
87
0
74
34
43
7
14
1.73
189053--189105
19
2.7
19
85
11
63
50
5
0
43
1.25
189071--189110
20
2.0
20
85
9
55
52
5
0
42
1.23
189698--189887
95
2.0
95
100
0
380
15
32
12
38
1.85
192401--192447
23
2.0
23
95
0
85
34
8
14
42
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
193176--193237
4
15.5
4
96
0
115
22
25
1
50
1.59
195782--195846
32
2.0
32
96
0
121
44
29
3
23
1.68
200598--200642
19
2.4
18
86
13
65
0
33
0
66
0.92
200852--200891
20
2.0
20
100
0
80
45
5
0
50
1.23
203022--203087
33
2.0
33
84
0
87
45
6
16
31
1.72
203029--203096
33
2.1
33
83
5
86
48
4
13
33
1.62
203077--203330
137
1.9
134
82
4
325
49
7
5
37
1.53
216890--216946
30
1.9
30
100
0
114
29
21
28
21
1.98
219708--219732
4
6.2
4
100
0
50
24
24
24
28
2.00
223426--223468
5
8.4
5
97
2
77
0
18
20
60
1.36
230674--230703
15
2.0
15
100
0
60
26
13
33
26
1.93
231788--231813
3
8.7
3
100
0
52
65
0
34
0
0.93
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42
2.1
42
100
0
176
30
30
23
14
1.95
247752--247935
69
2.7
69
73
5
174
34
20
21
23
1.97
254410--254462
9
5.9
9
93
0
79
1
22
0
75
0.90
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3
15.7
3
86
0
67
0
25
0
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256687--256738
6
8.7
6
97
0
77
23
0
59
17
1.37
269364--269398
16
2.2
16
90
5
54
0
17
0
82
0.66
274687--274732
13
3.1
15
79
20
53
56
0
0
43
0.99
279549--279578
15
2.0
15
100
0
60
93
0
6
0
0.35
281590--281618
5
5.8
5
100
0
58
82
0
0
17
0.66
281964--281997
14
2.5
13
86
9
50
26
2
0
70
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
290777--290802
5
5.2
5
100
0
52
0
19
0
80
0.71
295106--295148
4
10.8
4
100
0
86
0
48
25
25
1.51
295194--295219
3
8.7
3
100
0
52
0
34
0
65
0.93
306503--306538
17
2.1
17
100
0
72
33
22
5
38
1.77
326563--326608
23
2.0
22
95
4
83
34
17
17
30
1.93
339398--339484
40
2.1
41
85
2
113
22
1
9
66
1.27
341151--341215
31
2.1
30
88
8
96
58
9
1
30
1.39
342991--343023
16
2.1
16
100
0
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42
12
6
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347807--347849
20
2.2
20
83
8
52
23
2
0
74
0.93
347925--348068
20
7.0
21
72
19
110
42
1
1
54
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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