Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  274  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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264
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290
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Indices
Period
Size
Copy
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Percent
Matches
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Indels
Score
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Period
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0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
86992615--86992687
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124
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1
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5
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6
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70
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1
3
16
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23
2.4
24
85
8
73
78
1
3
15
0.96
87041831--87041907
17
4.4
17
77
9
75
77
1
3
16
0.98
87052279--87052308
14
2.1
15
93
6
53
63
13
10
13
1.52
87057238--87057278
21
2.0
21
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0
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87061030--87061205
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3.8
46
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189
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19
28
30
1.98
87061027--87061198
93
1.8
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93
0
299
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20
29
29
1.98
87065215--87065343
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2.0
65
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87065585--87065611
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0
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28
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1.99
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68
2.0
68
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20
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0
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24
27
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1.95
87075575--87075622
2
24.0
2
95
0
87
47
50
2
0
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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0
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28
1.94
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4.7
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28
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1.98
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2
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2
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0
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0
0
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48
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0
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0
0
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17
100
0
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18
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201
20
20
29
29
1.98
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1.8
93
93
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20
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20
2.8
20
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44
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3
48
1.38
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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1.32
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2.0
56
100
0
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30
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3
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0
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1.58
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18
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0
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11
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0
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0
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0
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0
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21
3
36
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87183768--87183805
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1.9
20
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0
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2.1
21
100
0
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0
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26
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3
0
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26
2.4
27
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10
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35
1
0
62
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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